RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, human

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTU2-208	ENST00000566637	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		28.16	■■■□□ 2.1
CTU2-208	ENST00000566637	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
CTU2-208	ENST00000566637	PTPRU	Q92729	1446 aa		28.14	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.13	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	TMC1	Q8TDI8	760 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	CABP2	Q9NPB3	220 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	PTCH1	Q13635	1447 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	RALBP1	Q15311	655 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
CTU2-208	ENST00000566637	CDK19	Q9BWU1	502 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CTU2-208	ENST00000566637	ADGRB2	O60241	1585 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CTU2-208	ENST00000566637	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CTU2-208	ENST00000566637	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CTU2-208	ENST00000566637	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CTU2-208	ENST00000566637	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
CTU2-208	ENST00000566637	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
CTU2-208	ENST00000566637	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
CTU2-208	ENST00000566637	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		28	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	MRS2	Q9HD23	443 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	USP32	Q8NFA0	1604 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	KCNA6	P17658	529 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CTU2-208	ENST00000566637	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	CCDC184	Q52MB2	194 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	ATP7B	P35670	1465 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637		A0A1W2PP64	1363 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	NLRP13	Q86W25	1043 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	NWD1	Q149M9	1564 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
CTU2-208	ENST00000566637	HSPA2	P54652	639 aa		27.89	■■■□□ 2.05
CTU2-208	ENST00000566637	CABP1	Q9NZU7	370 aa		27.89	■■■□□ 2.05
CTU2-208	ENST00000566637	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CTU2-208	ENST00000566637	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CTU2-208	ENST00000566637	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CTU2-208	ENST00000566637	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CTU2-208	ENST00000566637	NSD2	O96028	1365 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CTU2-208	ENST00000566637	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTU2-208	ENST00000566637	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTU2-208	ENST00000566637	ITSN1	Q15811	1721 aa		27.83	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	PPP2R1A	P30153	589 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	AKAP12	Q02952	1782 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	MORC1	Q86VD1	984 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CTU2-208	ENST00000566637	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	STRC	Q7RTU9	1775 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	NUTM2F	A1L443	756 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	C14orf37	Q86TY3	774 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CTU2-208	ENST00000566637	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	FYB1	O15117	783 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.67	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	ACE	P12821	1306 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	27.67	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
CTU2-208	ENST00000566637	USP6	P35125	1406 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CTU2-208	ENST00000566637	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
CTU2-208	ENST00000566637	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
CTU2-208	ENST00000566637	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CTU2-208	ENST00000566637	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CTU2-208	ENST00000566637	TMEM94	Q12767	1356 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CTU2-208	ENST00000566637	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	27.58	■■■□□ 2.01
CTU2-208	ENST00000566637	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		27.57	■■■□□ 2
CTU2-208	ENST00000566637	NME9	Q86XW9	330 aa		27.57	■■■□□ 2
CTU2-208	ENST00000566637	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		27.57	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms