RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 PRR20AP86496 221 aa8.53□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 MMP16P51512 607 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 HLA-CQ95604 372 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 TRIM66O15016 1216 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 SLC24A1O60721 1099 aa8.49□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.49□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 GDF9O60383 454 aa8.48□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 FDX1P10109 184 aa8.48□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 GUCA2AQ02747 115 aa8.48□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 RETREG3Q86VR2 466 aa8.48□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.48□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 BCANQ96GW7 911 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3-204ENST00000561685 JUNDP17535 347 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 GJA5P36382 358 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 DGAT1O75907 488 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 PKDCCQ504Y2 493 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 C6orf229H3BNL8 230 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 TNFRSF10AO00220 468 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 LCE2BO14633 110 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 PDE4DQ08499 809 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 MS4A1P11836 297 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 FOXC1Q12948 553 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 TRIM32Q13049 653 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 FAM187AA6NFU0 413 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 NDUFV2P19404 249 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 MTMR2Q13614 643 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-204ENST00000561685 WNT7AO00755 349 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 DESI1Q6ICB0 168 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 WNT7BP56706 349 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 PTPRNQ16849 979 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 CYP4X1Q8N118 509 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 SPTLC1O15269 473 aa8.37□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.37□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 MYT1Q01538 1121 aa8.37□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 PRR7Q8TB68 274 aa8.37□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RRN3-204ENST00000561685 AVPP01185 164 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 HRCP23327 699 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 SKOR1P84550 965 aa8.31□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 KCNH2Q12809 1159 aa8.31□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 ZNF787Q6DD87 383 aa8.3□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.3□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 LYPD8Q6UX82 237 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 AAASQ9NRG9 546 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 CFAP99D6REC4 459 aa8.28□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.28□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.28□□□□□ -1.08
RRN3-204ENST00000561685 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 AXIN1O15169 862 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 SMPD1P17405 629 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 ST8SIA5O15466 376 aa8.26□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 LILRB3O75022 631 aa8.26□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 SH3BP2P78314 561 aa8.26□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 CTHP32929 405 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 QPCTQ16769 361 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 J3QL48 77 aa8.24□□□□□ -1.09
RRN3-204ENST00000561685 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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