RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558139.1

LHX4-202, Transcript of LIM homeobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene LHX4, Length 721 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4-202ENST00000558139 BAG6P46379 1132 aa27.24■■□□□ 1.95
LHX4-202ENST00000558139 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.22■■□□□ 1.95
LHX4-202ENST00000558139 E9PCH4 1651 aa27.21■■□□□ 1.95
LHX4-202ENST00000558139 YY1P25490 414 aa27.21■■□□□ 1.95
LHX4-202ENST00000558139 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
LHX4-202ENST00000558139 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.2■■□□□ 1.94
LHX4-202ENST00000558139 GLI3P10071 1580 aa27.18■■□□□ 1.94
LHX4-202ENST00000558139 FOXO3O43524 673 aa27.17■■□□□ 1.94
LHX4-202ENST00000558139 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
LHX4-202ENST00000558139 SLIT2O94813 1529 aa27.16■■□□□ 1.94
LHX4-202ENST00000558139 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
LHX4-202ENST00000558139 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.16■■□□□ 1.94
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LHX4-202ENST00000558139 NUP155O75694 1391 aa27.14■■□□□ 1.94
LHX4-202ENST00000558139 VPS72Q15906 364 aa27.14■■□□□ 1.94
LHX4-202ENST00000558139 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.14■■□□□ 1.94
LHX4-202ENST00000558139 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.13■■□□□ 1.93
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LHX4-202ENST00000558139 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
LHX4-202ENST00000558139 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
LHX4-202ENST00000558139 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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LHX4-202ENST00000558139 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.07■■□□□ 1.92
LHX4-202ENST00000558139 A0A0G2JS52 829 aa27.06■■□□□ 1.92
LHX4-202ENST00000558139 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
LHX4-202ENST00000558139 MYT1Q01538 1121 aa27.06■■□□□ 1.92
LHX4-202ENST00000558139 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
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LHX4-202ENST00000558139 ROCK1Q13464 1354 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX4-202ENST00000558139 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX4-202ENST00000558139 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.94■■□□□ 1.9
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LHX4-202ENST00000558139 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.92■■□□□ 1.9
LHX4-202ENST00000558139 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.92■■□□□ 1.9
LHX4-202ENST00000558139 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
LHX4-202ENST00000558139 PLEKHG5O94827 1062 aa26.9■■□□□ 1.9
LHX4-202ENST00000558139 PSME1Q06323 249 aa26.9■■□□□ 1.9
LHX4-202ENST00000558139 DISP2A7MBM2 1401 aa26.9■■□□□ 1.9
LHX4-202ENST00000558139 NAIPQ13075 1403 aa26.89■■□□□ 1.89
LHX4-202ENST00000558139 FAM83GA6ND36 823 aa26.88■■□□□ 1.89
LHX4-202ENST00000558139 FAM182BQ5T319 152 aa26.88■■□□□ 1.89
LHX4-202ENST00000558139 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.87■■□□□ 1.89
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LHX4-202ENST00000558139 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
LHX4-202ENST00000558139 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.84■■□□□ 1.89
LHX4-202ENST00000558139 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.84■■□□□ 1.89
LHX4-202ENST00000558139 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.83■■□□□ 1.89
LHX4-202ENST00000558139 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.83■■□□□ 1.89
LHX4-202ENST00000558139 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.82■■□□□ 1.88
LHX4-202ENST00000558139 CLTCL1P53675 1640 aa26.81■■□□□ 1.88
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LHX4-202ENST00000558139 BTG4Q9NY30 223 aa26.81■■□□□ 1.88
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LHX4-202ENST00000558139 ARHGEF10O15013 1369 aa26.79■■□□□ 1.88
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LHX4-202ENST00000558139 APBA3O96018 575 aa26.77■■□□□ 1.88
LHX4-202ENST00000558139 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.77■■□□□ 1.88
LHX4-202ENST00000558139 SPON1Q9HCB6 807 aa26.77■■□□□ 1.88
LHX4-202ENST00000558139 ITGAEP38570 1179 aa26.75■■□□□ 1.87
LHX4-202ENST00000558139 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.74■■□□□ 1.87
LHX4-202ENST00000558139 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.74■■□□□ 1.87
LHX4-202ENST00000558139 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.74■■□□□ 1.87
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LHX4-202ENST00000558139 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.73■■□□□ 1.87
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LHX4-202ENST00000558139 NRAPQ86VF7 1730 aa26.62■■□□□ 1.85
LHX4-202ENST00000558139 C1QTNF8P60827 252 aa26.61■■□□□ 1.85
LHX4-202ENST00000558139 SIRT1Q96EB6 747 aa26.6■■□□□ 1.85
LHX4-202ENST00000558139 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
LHX4-202ENST00000558139 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.59■■□□□ 1.85
LHX4-202ENST00000558139 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.58■■□□□ 1.85
LHX4-202ENST00000558139 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.58■■□□□ 1.85
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LHX4-202ENST00000558139 PDE3BQ13370 1112 aa26.57■■□□□ 1.84
LHX4-202ENST00000558139 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.57■■□□□ 1.84
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