RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557454.1

NEDD1-211, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-211ENST00000557454 SLIT2O94813 1529 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-211ENST00000557454 UTRNP46939 3433 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-211ENST00000557454 METP08581 1390 aa15.05■□□□□ -0
NEDD1-211ENST00000557454 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.05■□□□□ -0
NEDD1-211ENST00000557454 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
NEDD1-211ENST00000557454 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.04■□□□□ -0
NEDD1-211ENST00000557454 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NEDD1-211ENST00000557454 KCNA4P22459 653 aa15.02■□□□□ -0
NEDD1-211ENST00000557454 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.01□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 CEP350Q5VT06 3117 aa15.01□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 PXDNQ92626 1479 aa15.01□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 C1QTNF8P60827 252 aa15□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 DAPK1P53355 1430 aa15□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 A0A0G2JS52 829 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 MYT1Q01538 1121 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 VPS72Q15906 364 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 DISP2A7MBM2 1401 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD1-211ENST00000557454 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 ADGRL2O95490 1459 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 FAM182BQ5T319 152 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 USP32Q8NFA0 1604 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 FOXO3O43524 673 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 SPON1Q9HCB6 807 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD1-211ENST00000557454 MSH5O43196 834 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 ADGRB2O60241 1585 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 E9PCH4 1651 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 KCNQ2O43526 872 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 PLEKHG5O94827 1062 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 TRIM37O94972 964 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-211ENST00000557454 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 APBA3O96018 575 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 HFM1A2PYH4 1435 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 NUTM2FA1L443 756 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 NBPF14Q5TI25 921 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 RREB1Q92766 1687 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 FAM83GA6ND36 823 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 NRAPQ86VF7 1730 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-211ENST00000557454 BTG4Q9NY30 223 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 NAIPQ13075 1403 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 ABCA3Q99758 1704 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 MYOM1P52179 1685 aa14.72□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 KIF1AQ12756 1690 aa14.72□□□□□ -0.05
NEDD1-211ENST00000557454 ZBTB7AO95365 584 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 ARHGEF10O15013 1369 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 NUP155O75694 1391 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 CHD4Q14839 1912 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 PTGER2P43116 358 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 PSME1Q06323 249 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 SYT17Q9BSW7 474 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 SBNO1A3KN83 1393 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 CASZ1Q86V15 1759 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD1-211ENST00000557454 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms