RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.07■■□□□ 1.76
AFG3L1P-217ENST00000557444 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
AFG3L1P-217ENST00000557444 WWC1Q8IX03 1113 aa26.06■■□□□ 1.76
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHPRHQ149N8 1683 aa26.05■■□□□ 1.76
AFG3L1P-217ENST00000557444 GLI2P10070 1586 aa26.04■■□□□ 1.76
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTHFSP49914 203 aa26.03■■□□□ 1.76
AFG3L1P-217ENST00000557444 IDI1Q13907 227 aa26.03■■□□□ 1.76
AFG3L1P-217ENST00000557444 CABP2Q9NPB3 220 aa26.03■■□□□ 1.76
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.01■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.01■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 STK26Q9P289 416 aa25.99■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIK3C2BO00750 1634 aa25.99■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.99■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.99■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCL11AQ9H165 835 aa25.98■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 EVC2Q86UK5 1308 aa25.98■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEO1Q92859 1461 aa25.98■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 RGS3P49796 1198 aa25.97■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.97■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 RUNDC1Q96C34 613 aa25.97■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 NGEFQ8N5V2 710 aa25.95■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
AFG3L1P-217ENST00000557444 PANK1Q8TE04 598 aa25.95■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.92■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHDP01880 384 aa25.92■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 COG6Q9Y2V7 657 aa25.92■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.92■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.92■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP32Q8NFA0 1604 aa25.91■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 C8orf34Q49A92 452 aa25.91■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 RICTORQ6R327 1708 aa25.91■■□□□ 1.74
AFG3L1P-217ENST00000557444 CFAP53Q96M91 514 aa25.89■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.89■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM161AQ3B820 660 aa25.88■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNNQ9UQP3 1299 aa25.88■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.88■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A1W2PP64 1363 aa25.87■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDE3AQ14432 1141 aa25.86■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.86■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.86■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC4A3P48751 1232 aa25.85■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.83■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRAM1Q96QH2 718 aa25.83■■□□□ 1.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 RLBP1P12271 317 aa25.82■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR63Q8IWG1 891 aa25.82■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 NSD2O96028 1365 aa25.81■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.8■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.8■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.79■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZFYVE9O95405 1425 aa25.79■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.79■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPRMP28827 1452 aa25.79■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCC11Q96J66 1382 aa25.79■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEFMP07197 916 aa25.78■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC27Q2M243 656 aa25.78■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 POGKQ9P215 609 aa25.78■■□□□ 1.72
AFG3L1P-217ENST00000557444 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.76■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 FYB1O15117 783 aa25.75■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.74■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.73■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.72■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.72■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.71■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADGRB2O60241 1585 aa25.71■■□□□ 1.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.7■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDK19Q9BWU1 502 aa25.69■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.69■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 CABP1Q9NZU7 370 aa25.69■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 FBLN1P23142 703 aa25.68■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.68■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 NLRP1Q9C000 1473 aa25.67■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.67■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALKQ9UM73 1620 aa25.67■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEC24BO95487 1268 aa25.67■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.66■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.2 ms