RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	UBXN4	Q92575	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483		A6NJR5	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	MS4A1	P11836	297 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	BDNF	P23560	247 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	COPB2	P35606	906 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	TDO2	P48775	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	EXOC5	O00471	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	SEMA3E	O15041	775 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-231	ENST00000551483	BIRC2	Q13490	618 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	GYS2	P54840	703 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	ZMYND10	O75800	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR29	P0C7W0	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	MAF1	Q9H063	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	SMAP	O00193	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	LMNB1	P20700	586 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	AK7	Q96M32	723 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	RFX1	P22670	979 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	USP5	P45974	858 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	ICE2	Q659A1	982 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	HOXA2	O43364	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64	1e-6	■■□□□ 12.7
CNOT2-231	ENST00000551483	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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