RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 MAP2K5Q13163 448 aa12.35□□□□□ -0.43
HECTD4-210ENST00000549306 KDM4AO75164 1064 aa12.34□□□□□ -0.43
HECTD4-210ENST00000549306 CTC1Q2NKJ3 1217 aa12.34□□□□□ -0.43
HECTD4-210ENST00000549306 DACH1Q9UI36 760 aa12.34□□□□□ -0.43
HECTD4-210ENST00000549306 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
HECTD4-210ENST00000549306 MMP16P51512 607 aa12.33□□□□□ -0.44
HECTD4-210ENST00000549306 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.33□□□□□ -0.44
HECTD4-210ENST00000549306 IRF6O14896 467 aa12.32□□□□□ -0.44
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HECTD4-210ENST00000549306 TRIM32Q13049 653 aa12.31□□□□□ -0.44
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HECTD4-210ENST00000549306 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
HECTD4-210ENST00000549306 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
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HECTD4-210ENST00000549306 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
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HECTD4-210ENST00000549306 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.17□□□□□ -0.46
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HECTD4-210ENST00000549306 RETREG3Q86VR2 466 aa12.12□□□□□ -0.47
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HECTD4-210ENST00000549306 EHBP1Q8NDI1 1231 aa12.06□□□□□ -0.48
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HECTD4-210ENST00000549306 MS4A1P11836 297 aa12.04□□□□□ -0.48
HECTD4-210ENST00000549306 SIAH2O43255 324 aa12.03□□□□□ -0.48
HECTD4-210ENST00000549306 WIPF1O43516 503 aa12.03□□□□□ -0.48
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HECTD4-210ENST00000549306 SPIRE2Q8WWL2 714 aa12.02□□□□□ -0.49
HECTD4-210ENST00000549306 SH3BP2P78314 561 aa12□□□□□ -0.49
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HECTD4-210ENST00000549306 DESI1Q6ICB0 168 aa11.92□□□□□ -0.5
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HECTD4-210ENST00000549306 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HECTD4-210ENST00000549306 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF511Q8NB15 262 aa11.9□□□□□ -0.5
HECTD4-210ENST00000549306 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.9□□□□□ -0.5
HECTD4-210ENST00000549306 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.88□□□□□ -0.51
HECTD4-210ENST00000549306 CTHP32929 405 aa11.87□□□□□ -0.51
HECTD4-210ENST00000549306 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.87□□□□□ -0.51
HECTD4-210ENST00000549306 MPNDQ8N594 471 aa11.87□□□□□ -0.51
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