RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547752.5

PTPRR-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, human

TSL 2

Gene PTPRR, Length 1,729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRR-206	ENST00000547752	PRAM1	Q96QH2	718 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	POGK	Q9P215	609 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	USP47	Q96K76	1375 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	C14orf37	Q86TY3	774 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	MSH6	P52701	1360 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	TESK2	Q96S53	571 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	DCC	P43146	1447 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	ADGRB2	O60241	1585 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-206	ENST00000547752	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	ATF3	P18847	181 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	MST1R	Q04912	1400 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	NUTM2F	A1L443	756 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	TOM1	O60784	492 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	USP32	Q8NFA0	1604 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	EVC2	Q86UK5	1308 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRR-206	ENST00000547752	ORAI2	Q96SN7	254 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	ATP7B	P35670	1465 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	TMF1	P82094	1093 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-206	ENST00000547752	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	CABP1	Q9NZU7	370 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	FOXO3	O43524	673 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	ACE	P12821	1306 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	ITSN1	Q15811	1721 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	HSPA1L	P34931	641 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	PXDN	Q92626	1479 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-206	ENST00000547752	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-206	ENST00000547752	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-206	ENST00000547752	MYOM1	P52179	1685 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPRR-206	ENST00000547752	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPRR-206	ENST00000547752	PSME1	Q06323	249 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPRR-206	ENST00000547752	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPRR-206	ENST00000547752	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PTPRR-206	ENST00000547752	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPRR-206	ENST00000547752		A0A1W2PP64	1363 aa		13.36	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms