RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRB-205ENST00000547715 CCDC125Q86Z20 511 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRB-205ENST00000547715 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRB-205ENST00000547715 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRB-205ENST00000547715 HFM1A2PYH4 1435 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRB-205ENST00000547715 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRB-205ENST00000547715 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRB-205ENST00000547715 PXDNQ92626 1479 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRB-205ENST00000547715 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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PTPRB-205ENST00000547715 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTPRB-205ENST00000547715 FOXO3O43524 673 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPRB-205ENST00000547715 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRB-205ENST00000547715 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRB-205ENST00000547715 NUTM2FA1L443 756 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRB-205ENST00000547715 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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PTPRB-205ENST00000547715 NAIPQ13075 1403 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRB-205ENST00000547715 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRB-205ENST00000547715 SLIT2O94813 1529 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRB-205ENST00000547715 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRB-205ENST00000547715 STK26Q9P289 416 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRB-205ENST00000547715 USP32Q8NFA0 1604 aa21.94■■□□□ 1.1
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PTPRB-205ENST00000547715 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRB-205ENST00000547715 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRB-205ENST00000547715 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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PTPRB-205ENST00000547715 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.89■■□□□ 1.1
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PTPRB-205ENST00000547715 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRB-205ENST00000547715 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRB-205ENST00000547715 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRB-205ENST00000547715 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRB-205ENST00000547715 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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PTPRB-205ENST00000547715 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRB-205ENST00000547715 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRB-205ENST00000547715 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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PTPRB-205ENST00000547715 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.85■■□□□ 1.09
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PTPRB-205ENST00000547715 IFT172Q9UG01 1749 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRB-205ENST00000547715 ABCC11Q96J66 1382 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRB-205ENST00000547715 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRB-205ENST00000547715 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRB-205ENST00000547715 ABCA3Q99758 1704 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRB-205ENST00000547715 PSME1Q06323 249 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRB-205ENST00000547715 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRB-205ENST00000547715 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRB-205ENST00000547715 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRB-205ENST00000547715 MYT1Q01538 1121 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRB-205ENST00000547715 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRB-205ENST00000547715 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRB-205ENST00000547715 BAG6P46379 1132 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRB-205ENST00000547715 PIK3C2GO75747 1445 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRB-205ENST00000547715 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRB-205ENST00000547715 SBNO1A3KN83 1393 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRB-205ENST00000547715 ARHGEF10O15013 1369 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRB-205ENST00000547715 FAM83GA6ND36 823 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRB-205ENST00000547715 HRCP23327 699 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRB-205ENST00000547715 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRB-205ENST00000547715 NRAPQ86VF7 1730 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRB-205ENST00000547715 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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PTPRB-205ENST00000547715 SIRT1Q96EB6 747 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRB-205ENST00000547715 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 BTG4Q9NY30 223 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 FAM182BQ5T319 152 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
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PTPRB-205ENST00000547715 PRAM1Q96QH2 718 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
PTPRB-205ENST00000547715 ALS2Q96Q42 1657 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRB-205ENST00000547715 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRB-205ENST00000547715 POGKQ9P215 609 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRB-205ENST00000547715 ADGRB2O60241 1585 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRB-205ENST00000547715 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRB-205ENST00000547715 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRB-205ENST00000547715 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.6■■□□□ 1.05
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