RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-208ENST00000546997 DLC1Q96QB1 1528 aa22.52■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 TMF1P82094 1093 aa22.51■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 ABCC11Q96J66 1382 aa22.5■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 PTPRUQ92729 1446 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 CPS1P31327 1500 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 TECPR2O15040 1411 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 PRAM1Q96QH2 718 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 TBX22Q9Y458 520 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.47■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.47■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 HSPA2P54652 639 aa22.47■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.46■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
BRF1-208ENST00000546997 MYOM1P52179 1685 aa22.45■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.44■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 POGKQ9P215 609 aa22.44■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.44■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.41■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 STRCQ7RTU9 1775 aa22.4■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.4■■□□□ 1.18
BRF1-208ENST00000546997 CDCA8Q53HL2 280 aa22.39■■□□□ 1.17
BRF1-208ENST00000546997 PIK3R4Q99570 1358 aa22.39■■□□□ 1.17
BRF1-208ENST00000546997 PTCH1Q13635 1447 aa22.38■■□□□ 1.17
BRF1-208ENST00000546997 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
BRF1-208ENST00000546997 SIRT1Q96EB6 747 aa22.37■■□□□ 1.17
BRF1-208ENST00000546997 EVC2Q86UK5 1308 aa22.36■■□□□ 1.17
BRF1-208ENST00000546997 KCNA6P17658 529 aa22.34■■□□□ 1.17
BRF1-208ENST00000546997 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.34■■□□□ 1.17
BRF1-208ENST00000546997 CABP2Q9NPB3 220 aa22.32■■□□□ 1.16
BRF1-208ENST00000546997 ADGRB2O60241 1585 aa22.32■■□□□ 1.16
BRF1-208ENST00000546997 NWD1Q149M9 1564 aa22.3■■□□□ 1.16
BRF1-208ENST00000546997 ZBTB22O15209 634 aa22.3■■□□□ 1.16
BRF1-208ENST00000546997 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
BRF1-208ENST00000546997 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
BRF1-208ENST00000546997 PANK3Q9H999 370 aa22.29■■□□□ 1.16
BRF1-208ENST00000546997 CDK19Q9BWU1 502 aa22.29■■□□□ 1.16
BRF1-208ENST00000546997 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.28■■□□□ 1.16
BRF1-208ENST00000546997 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.26■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.25■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 TMC1Q8TDI8 760 aa22.24■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.23■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 ATP7BP35670 1465 aa22.2■■□□□ 1.15
BRF1-208ENST00000546997 MSH5O43196 834 aa22.2■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 USP32Q8NFA0 1604 aa22.2■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.19■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 CCDC184Q52MB2 194 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 A0A1W2PP64 1363 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 NUTM2FA1L443 756 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 CABP1Q9NZU7 370 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.14■■□□□ 1.14
BRF1-208ENST00000546997 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 ITSN1Q15811 1721 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 MRS2Q9HD23 443 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 AKAP12Q02952 1782 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 C14orf37Q86TY3 774 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 TMEM94Q12767 1356 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-208ENST00000546997 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.08■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 RALBP1Q15311 655 aa22.04■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.04■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.04■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.03■■□□□ 1.12
BRF1-208ENST00000546997 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.03■■□□□ 1.12
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