RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	S1PR4	O95977	384 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	GGCX	P38435	758 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	MSS51	Q4VC12	460 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	RNF223	E7ERA6	249 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	C6orf229	H3BNL8	230 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	RETREG3	Q86VR2	466 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	MTMR2	Q13614	643 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	IL27	Q8NEV9	243 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	MMP16	P51512	607 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-233	ENST00000545204	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	RGS20	O76081	388 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	HRC	P23327	699 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	QPCT	Q16769	361 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	LILRB3	O75022	631 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	GOPC	Q9HD26	462 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	JUND	P17535	347 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	PRR7	Q8TB68	274 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	6.94	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	CFAP99	D6REC4	459 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	DESI1	Q6ICB0	168 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
MDM2-233	ENST00000545204	SLC19A1	P41440	591 aa		6.89	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	PTPRN	Q16849	979 aa		6.89	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		6.89	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		6.88	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	LYPD8	Q6UX82	237 aa		6.88	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		6.88	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	RPIA	P49247	311 aa		6.87	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		6.87	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	SPRYD7	Q5W111	196 aa		6.86	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	TSC1	Q92574	1164 aa		6.86	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	RFC5	P40937	340 aa		6.85	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		6.85	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM32	Q13049	653 aa		6.84	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
MDM2-233	ENST00000545204	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		6.83	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	KCNH2	Q12809	1159 aa		6.83	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		6.83	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	MAP10	Q9P2G4	905 aa		6.83	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	AP1G2	O75843	785 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	CTH	P32929	405 aa		6.81	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		6.81	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		6.81	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	6.81	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	USP17L8	P0C7I0	530 aa		6.8	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		6.8	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	WNT7B	P56706	349 aa		6.79	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		6.79	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	GDF9	O60383	454 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	SKOR1	P84550	965 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	6.78	□□□□□ -1.32
MDM2-233	ENST00000545204	WNT7A	O00755	349 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	PRR20E	P86478	221 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	PRR20C	P86479	221 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	PRR20D	P86480	221 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	PRR20B	P86481	221 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	PRR20A	P86496	221 aa		6.77	□□□□□ -1.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms