RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	ZPR1	O75312	459 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	MTMR2	Q13614	643 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	QPCT	Q16769	361 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF516	Q92618	1163 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	9.63	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	HRC	P23327	699 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	KCNC4	Q03721	635 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	LILRB3	O75022	631 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	BRICD5	Q6PL45	260 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	SPSB2	Q99619	263 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	TLL1	O43897	1013 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	RETREG3	Q86VR2	466 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	THAP11	Q96EK4	314 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87
MDM2-231	ENST00000544125	ADH1B	P00325	375 aa		9.58	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		9.58	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	TSC1	Q92574	1164 aa		9.58	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	PRR7	Q8TB68	274 aa		9.57	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	RFC5	P40937	340 aa		9.56	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	9.56	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		9.56	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	9.55	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	CFAP99	D6REC4	459 aa		9.54	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	9.54	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		9.54	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	AP1G2	O75843	785 aa		9.53	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	MSS51	Q4VC12	460 aa		9.53	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		9.53	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		9.53	□□□□□ -0.88
MDM2-231	ENST00000544125	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		9.52	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		9.52	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	S1PR4	O95977	384 aa		9.51	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	JUND	P17535	347 aa		9.51	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	GGCX	P38435	758 aa		9.5	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	DESI1	Q6ICB0	168 aa		9.5	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		9.49	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	MMP16	P51512	607 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	IFFO2	Q5TF58	517 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	BANK1	Q8NDB2	785 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MDM2-231	ENST00000544125	USP17L8	P0C7I0	530 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	LYPD8	Q6UX82	237 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	PTPRN	Q16849	979 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	RNF223	E7ERA6	249 aa		9.43	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		9.43	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		9.43	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	SNRK	Q9NRH2	765 aa		9.43	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	CTH	P32929	405 aa		9.42	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	FLII	Q13045	1269 aa		9.42	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125		A0A0G2JS52	829 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MDM2-231	ENST00000544125	APBB1	O00213	710 aa		9.39	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	MCM6	Q14566	821 aa		9.39	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	KCNH2	Q12809	1159 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	MAP10	Q9P2G4	905 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	NR6A1	Q15406	480 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	SOCS7	O14512	581 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	PNMA1	Q8ND90	353 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MDM2-231	ENST00000544125	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		9.33	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	RAD21	O60216	631 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	SLC19A1	P41440	591 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	RPIA	P49247	311 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MDM2-231	ENST00000544125	C14orf37	Q86TY3	774 aa		9.3	□□□□□ -0.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms