RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.61■■■■□ 3.45
PTPRJ-206ENST00000534219 SHPRHQ149N8 1683 aa36.6■■■■□ 3.45
PTPRJ-206ENST00000534219 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PTPRJ-206ENST00000534219 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPRJ-206ENST00000534219 MYOM2P54296 1465 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPRJ-206ENST00000534219 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.56■■■■□ 3.44
PTPRJ-206ENST00000534219 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.55■■■■□ 3.44
PTPRJ-206ENST00000534219 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.55■■■■□ 3.44
PTPRJ-206ENST00000534219 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
PTPRJ-206ENST00000534219 NUTM2FA1L443 756 aa36.53■■■■□ 3.44
PTPRJ-206ENST00000534219 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.53■■■■□ 3.44
PTPRJ-206ENST00000534219 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.52■■■■□ 3.44
PTPRJ-206ENST00000534219 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.51■■■■□ 3.44
PTPRJ-206ENST00000534219 SIRT1Q96EB6 747 aa36.5■■■■□ 3.43
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
PTPRJ-206ENST00000534219 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.49■■■■□ 3.43
PTPRJ-206ENST00000534219 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
PTPRJ-206ENST00000534219 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.47■■■■□ 3.43
PTPRJ-206ENST00000534219 LAMC1P11047 1609 aa36.45■■■■□ 3.42
PTPRJ-206ENST00000534219 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.43■■■■□ 3.42
PTPRJ-206ENST00000534219 PRAM1Q96QH2 718 aa36.43■■■■□ 3.42
PTPRJ-206ENST00000534219 FOXO3O43524 673 aa36.42■■■■□ 3.42
PTPRJ-206ENST00000534219 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.42
PTPRJ-206ENST00000534219 POGKQ9P215 609 aa36.41■■■■□ 3.42
PTPRJ-206ENST00000534219 STAC3Q96MF2 364 aa36.4■■■■□ 3.42
PTPRJ-206ENST00000534219 C8orf37Q96NL8 207 aa36.39■■■■□ 3.42
PTPRJ-206ENST00000534219 AFF2P51816 1311 aa36.37■■■■□ 3.41
PTPRJ-206ENST00000534219 ADAMTS2O95450 1211 aa36.37■■■■□ 3.41
PTPRJ-206ENST00000534219 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
PTPRJ-206ENST00000534219 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.36■■■■□ 3.41
PTPRJ-206ENST00000534219 RXRBP28702 533 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPRJ-206ENST00000534219 NGLY1Q96IV0 654 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPRJ-206ENST00000534219 ADGRB1O14514 1584 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPRJ-206ENST00000534219 PXDNQ92626 1479 aa36.29■■■■□ 3.4
PTPRJ-206ENST00000534219 DLC1Q96QB1 1528 aa36.29■■■■□ 3.4
PTPRJ-206ENST00000534219 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.28■■■■□ 3.4
PTPRJ-206ENST00000534219 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.25■■■■□ 3.39
PTPRJ-206ENST00000534219 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
PTPRJ-206ENST00000534219 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.22■■■■□ 3.39
PTPRJ-206ENST00000534219 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
PTPRJ-206ENST00000534219 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
PTPRJ-206ENST00000534219 KIF1AQ12756 1690 aa36.18■■■■□ 3.38
PTPRJ-206ENST00000534219 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
PTPRJ-206ENST00000534219 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.16■■■■□ 3.38
PTPRJ-206ENST00000534219 PSME1Q06323 249 aa36.16■■■■□ 3.38
PTPRJ-206ENST00000534219 USP21Q9UK80 565 aa36.15■■■■□ 3.38
PTPRJ-206ENST00000534219 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.14■■■■□ 3.38
PTPRJ-206ENST00000534219 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
PTPRJ-206ENST00000534219 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.13■■■■□ 3.37
PTPRJ-206ENST00000534219 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
PTPRJ-206ENST00000534219 ADGRB2O60241 1585 aa36.1■■■■□ 3.37
PTPRJ-206ENST00000534219 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
PTPRJ-206ENST00000534219 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
PTPRJ-206ENST00000534219 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPRJ-206ENST00000534219 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
PTPRJ-206ENST00000534219 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
PTPRJ-206ENST00000534219 PLEKHG5O94827 1062 aa36.06■■■■□ 3.36
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PTPRJ-206ENST00000534219 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
PTPRJ-206ENST00000534219 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPRJ-206ENST00000534219 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.04■■■■□ 3.36
PTPRJ-206ENST00000534219 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.03■■■■□ 3.36
PTPRJ-206ENST00000534219 USP32Q8NFA0 1604 aa36.03■■■■□ 3.36
PTPRJ-206ENST00000534219 SBNO1A3KN83 1393 aa36.02■■■■□ 3.36
PTPRJ-206ENST00000534219 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.02■■■■□ 3.36
PTPRJ-206ENST00000534219 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.01■■■■□ 3.36
PTPRJ-206ENST00000534219 NEUROD1Q13562 356 aa35.99■■■■□ 3.35
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PTPRJ-206ENST00000534219 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.99■■■■□ 3.35
PTPRJ-206ENST00000534219 RGS12O14924 1447 aa35.99■■■■□ 3.35
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PTPRJ-206ENST00000534219 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.97■■■■□ 3.35
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGEF10O15013 1369 aa35.97■■■■□ 3.35
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PTPRJ-206ENST00000534219 ATRNO75882 1429 aa35.94■■■■□ 3.34
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PTPRJ-206ENST00000534219 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.34
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PTPRJ-206ENST00000534219 ATP7BP35670 1465 aa35.86■■■■□ 3.33
PTPRJ-206ENST00000534219 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
PTPRJ-206ENST00000534219 SLIT2O94813 1529 aa35.84■■■■□ 3.33
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.82■■■■□ 3.32
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PTPRJ-206ENST00000534219 ACEP12821 1306 aa35.76■■■■□ 3.31
PTPRJ-206ENST00000534219 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.76■■■■□ 3.31
PTPRJ-206ENST00000534219 ITSN1Q15811 1721 aa35.75■■■■□ 3.31
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
PTPRJ-206ENST00000534219 CABP2Q9NPB3 220 aa35.74■■■■□ 3.31
PTPRJ-206ENST00000534219 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRJ-206ENST00000534219 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRJ-206ENST00000534219 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
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