RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADGRB2O60241 1585 aa23.61■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATF3P18847 181 aa23.6■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STK26Q9P289 416 aa23.59■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MST1RQ04912 1400 aa23.57■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.56■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.56■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.56■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIP4K2BP78356 416 aa23.55■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.54■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLAIN2Q9P270 581 aa23.54■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.52■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.51■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRAM1Q96QH2 718 aa23.51■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.51■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.49■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.49■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POGKQ9P215 609 aa23.48■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.48■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHLPP1O60346 1717 aa23.47■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.47■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF1AQ12756 1690 aa23.46■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.44■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.44■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ITSN1Q15811 1721 aa23.43■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.43■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HSPA1LP34931 641 aa23.43■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.42■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BRINP3Q76B58 766 aa23.41■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP32Q8NFA0 1604 aa23.41■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SHPRHQ149N8 1683 aa23.36■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.36■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.36■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.34■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP7BP35670 1465 aa23.33■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.3■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-211ENST00000533653 JCADQ9P266 1359 aa23.29■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.29■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ORAI2Q96SN7 254 aa23.29■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PXDNQ92626 1479 aa23.28■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUTM2FA1L443 756 aa23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EVC2Q86UK5 1308 aa23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDK19Q9BWU1 502 aa23.23■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC24A1O60721 1099 aa23.22■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP47Q96K76 1375 aa23.22■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.2■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.19■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXO3O43524 673 aa23.18■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.17■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.17■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SBNO1A3KN83 1393 aa23.16■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.16■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ALS2Q96Q42 1657 aa23.16■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.15■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PSME1Q06323 249 aa23.14■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AKAP12Q02952 1782 aa23.14■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.13■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.12■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TESK2Q96S53 571 aa23.12■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CABP2Q9NPB3 220 aa23.12■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.11■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.11■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGEF10O15013 1369 aa23.11■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCA3Q99758 1704 aa23.11■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.1■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCNA4P22459 653 aa23.1■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRP6O75581 1613 aa23.1■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.09■■□□□ 1.29
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