RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 HDGFP51858 240 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PACS1-211ENST00000531298 SIRT1Q96EB6 747 aa10.16□□□□□ -0.78
PACS1-211ENST00000531298 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.16□□□□□ -0.78
PACS1-211ENST00000531298 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PACS1-211ENST00000531298 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
PACS1-211ENST00000531298 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.14□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.14□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.14□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 POLR3GLQ9BT43 218 aa10.14□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 ALKQ9UM73 1620 aa10.14□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.13□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 EVC2Q86UK5 1308 aa10.13□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 MED14O60244 1454 aa10.13□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 NLRP1Q9C000 1473 aa10.13□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.13□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 NUDCQ9Y266 331 aa10.12□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 ZMYM3Q14202 1370 aa10.12□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 ABCC11Q96J66 1382 aa10.12□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 PTPRMP28827 1452 aa10.11□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 TECPR2O15040 1411 aa10.11□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa10.11□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.1□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.1□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 RIMS2Q9UQ26 1411 aa10.09□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 PPP2R1AP30153 589 aa10.09□□□□□ -0.79
PACS1-211ENST00000531298 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.08□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.08□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 ABCB7O75027 752 aa10.08□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 TNRQ92752 1358 aa10.08□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.07□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.07□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 CPS1P31327 1500 aa10.07□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 ATP7BP35670 1465 aa10.06□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 FKBP8Q14318 412 aa10.06□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.06□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 SLIT1O75093 1534 aa10.06□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 DIP2AQ14689 1571 aa10.05□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.05□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.05□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.05□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.04□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 POLA2Q14181 598 aa10.04□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 ADGRB2O60241 1585 aa10.04□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa10.03□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.03□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 NSD3Q9BZ95 1437 aa10.03□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 PPP4R2Q9NY27 417 aa10.03□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 TERF2IPQ9NYB0 399 aa10.03□□□□□ -0.8
PACS1-211ENST00000531298 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 C3P01024 1663 aa10.02□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 ZNF521Q96K83 1311 aa10.02□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.01□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa10.01□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 PIK3R4Q99570 1358 aa10.01□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 SHPRHQ149N8 1683 aa9.99□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.99□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 CFAP53Q96M91 514 aa9.99□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.99□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 POGKQ9P215 609 aa9.99□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.99□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.99□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.98□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 CCDC27Q2M243 656 aa9.98□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 MORC1Q86VD1 984 aa9.98□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 PRAM1Q96QH2 718 aa9.98□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PP64 1363 aa9.98□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 PTCH1Q13635 1447 aa9.98□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 TBX22Q9Y458 520 aa9.97□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.97□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.96□□□□□ -0.81
PACS1-211ENST00000531298 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 AKAP12Q02952 1782 aa9.96□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 GOLGA2Q08379 1002 aa9.95□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 CDK19Q9BWU1 502 aa9.95□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.95□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 EID1Q9Y6B2 187 aa9.95□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.95□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.94□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 E9PSI1 815 aa9.94□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.94□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.93□□□□□ -0.82
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