RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 FOXC1Q12948 553 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 MSS51Q4VC12 460 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 IRF6O14896 467 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 Q3C1V9 767 aa8.42□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 KDM4AO75164 1064 aa8.41□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 AAASQ9NRG9 546 aa8.41□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.41□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 POTECB2RU33 542 aa8.4□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 ST8SIA5O15466 376 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 MMP16P51512 607 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 USP46P62068 366 aa8.38□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 CYP4X1Q8N118 509 aa8.38□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.38□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 AVPP01185 164 aa8.37□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC102AQ96A19 550 aa8.37□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-CQ95604 372 aa8.35□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.35□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.34□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 HOXA2O43364 376 aa8.34□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 CLCN1P35523 988 aa8.34□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM32Q13049 653 aa8.34□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.34□□□□□ -1.07
HDAC2-216ENST00000523628 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 WNT7AO00755 349 aa8.33□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 AXIN1O15169 862 aa8.32□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 DACH1Q9UI36 760 aa8.32□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 GUCA2AQ02747 115 aa8.31□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.3□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.3□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 SMPD1P17405 629 aa8.29□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.29□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 JUNDP17535 347 aa8.28□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HDAC2-216ENST00000523628 ZMYND10O75800 440 aa8.27□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.27□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 J3QL48 77 aa8.26□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 WNT7BP56706 349 aa8.26□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 SKOR1P84550 965 aa8.26□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 TREML4Q6UXN2 200 aa8.26□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 RETREG3Q86VR2 466 aa8.26□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 FDX1P10109 184 aa8.25□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.25□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 BARGINQ6ZT62 677 aa8.23□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.23□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.23□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.23□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.22□□□□□ -1.09
HDAC2-216ENST00000523628 C6orf229H3BNL8 230 aa8.21□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 HPS1Q92902 700 aa8.21□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 AMHR2Q16671 573 aa8.2□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFV2P19404 249 aa8.19□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.18□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 SIAH2O43255 324 aa8.18□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 WFS1O76024 890 aa8.18□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.18□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 MS4A1P11836 297 aa8.18□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 SENP2Q9HC62 589 aa8.18□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 ALDH1A1P00352 501 aa8.17□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRNQ16849 979 aa8.17□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.17□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM47Q96LD4 638 aa8.17□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 SH3BP2P78314 561 aa8.16□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 SCRIBQ14160 1630 aa8.16□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.16□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 MTMR2Q13614 643 aa8.15□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 PRR7Q8TB68 274 aa8.15□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 KIFC2Q96AC6 838 aa8.15□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.15□□□□□ -1.1
HDAC2-216ENST00000523628 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.14□□□□□ -1.11
HDAC2-216ENST00000523628 KCNH2Q12809 1159 aa8.14□□□□□ -1.11
HDAC2-216ENST00000523628 DESI1Q6ICB0 168 aa8.14□□□□□ -1.11
HDAC2-216ENST00000523628 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.14□□□□□ -1.11
HDAC2-216ENST00000523628 GJA5P36382 358 aa8.13□□□□□ -1.11
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