RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 INSRP06213 1382 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 MORC1Q86VD1 984 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 CDK19Q9BWU1 502 aa23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 ABCC11Q96J66 1382 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 METP08581 1390 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TSNARE1-204ENST00000519651 PDE3BQ13370 1112 aa23.32■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 DLC1Q96QB1 1528 aa23.32■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 NLRP1Q9C000 1473 aa23.32■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.32■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A1W2PP64 1363 aa23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 LTKP29376 864 aa23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 CABP1Q9NZU7 370 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 EID1Q9Y6B2 187 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-204ENST00000519651 C3P01024 1663 aa23.27■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 NSD2O96028 1365 aa23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 USP32Q8NFA0 1604 aa23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 SIRT1Q96EB6 747 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 MTHFSP49914 203 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.2■■□□□ 1.31
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 TECPR2O15040 1411 aa23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 FYB1O15117 783 aa23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 CFAP53Q96M91 514 aa23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 APAF1O14727 1248 aa23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.14■■□□□ 1.3
TSNARE1-204ENST00000519651 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
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TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.14■■□□□ 1.29
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TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1-204ENST00000519651 TBX22Q9Y458 520 aa23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF521Q96K83 1311 aa23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1-204ENST00000519651 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1-204ENST00000519651 ATP7BP35670 1465 aa23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1-204ENST00000519651 MED14O60244 1454 aa23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1-204ENST00000519651 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1-204ENST00000519651 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1-204ENST00000519651 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
TSNARE1-204ENST00000519651 NGEFQ8N5V2 710 aa23.08■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 PTPRUQ92729 1446 aa23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 RUNDC1Q96C34 613 aa23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 SHPRHQ149N8 1683 aa23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.05■■□□□ 1.28
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TSNARE1-204ENST00000519651 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 SLFN5Q08AF3 891 aa23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 NUTM2FA1L443 756 aa23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 NEUROD2Q15784 382 aa23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1-204ENST00000519651 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 WWC1Q8IX03 1113 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 NME9Q86XW9 330 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 E9PSI1 815 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 FBLN1P23142 703 aa22.99■■□□□ 1.27
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