RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-207ENST00000510021 METP08581 1390 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE2B-207ENST00000510021 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE2B-207ENST00000510021 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.43■■□□□ 1.5
UBE2B-207ENST00000510021 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
UBE2B-207ENST00000510021 PXDNQ92626 1479 aa24.41■■□□□ 1.5
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
UBE2B-207ENST00000510021 DISP2A7MBM2 1401 aa24.4■■□□□ 1.5
UBE2B-207ENST00000510021 DAPK1P53355 1430 aa24.38■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.38■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 VPS72Q15906 364 aa24.37■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 C1QTNF8P60827 252 aa24.36■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.36■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.35■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 USP32Q8NFA0 1604 aa24.35■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.34■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.33■■□□□ 1.49
UBE2B-207ENST00000510021 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.32■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 ADGRL2O95490 1459 aa24.32■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.3■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.3■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 CEP350Q5VT06 3117 aa24.29■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 E9PCH4 1651 aa24.29■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.28■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
UBE2B-207ENST00000510021 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.25■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 A0A0G2JS52 829 aa24.24■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 MYT1Q01538 1121 aa24.24■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.24■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 ADGRB2O60241 1585 aa24.24■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 FOXO3O43524 673 aa24.23■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.23■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 UTRNP46939 3433 aa24.23■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 FAM182BQ5T319 152 aa24.21■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 SPON1Q9HCB6 807 aa24.21■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 RREB1Q92766 1687 aa24.21■■□□□ 1.47
UBE2B-207ENST00000510021 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.19■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.18■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.18■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.18■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.18■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.18■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 KCNQ2O43526 872 aa24.16■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 NRAPQ86VF7 1730 aa24.15■■□□□ 1.46
UBE2B-207ENST00000510021 CHD4Q14839 1912 aa24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 HFM1A2PYH4 1435 aa24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 ABCA3Q99758 1704 aa24.12■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.11■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.1■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 TRIM37O94972 964 aa24.08■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.08■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 NBPF14Q5TI25 921 aa24.08■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.08■■□□□ 1.45
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.07■■□□□ 1.44
UBE2B-207ENST00000510021 APBA3O96018 575 aa24.06■■□□□ 1.44
UBE2B-207ENST00000510021 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.04■■□□□ 1.44
UBE2B-207ENST00000510021 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.04■■□□□ 1.44
UBE2B-207ENST00000510021 FAM83GA6ND36 823 aa24.04■■□□□ 1.44
UBE2B-207ENST00000510021 KIF1AQ12756 1690 aa24.03■■□□□ 1.44
UBE2B-207ENST00000510021 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.01■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 NAIPQ13075 1403 aa24■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 NUTM2FA1L443 756 aa23.99■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.99■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.99■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 PLEKHG5O94827 1062 aa23.98■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 MYOM1P52179 1685 aa23.98■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 BTG4Q9NY30 223 aa23.97■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 CASZ1Q86V15 1759 aa23.96■■□□□ 1.43
UBE2B-207ENST00000510021 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
UBE2B-207ENST00000510021 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.93■■□□□ 1.42
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGEF10O15013 1369 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2B-207ENST00000510021 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
UBE2B-207ENST00000510021 SBNO1A3KN83 1393 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2B-207ENST00000510021 CLTCL1P53675 1640 aa23.89■■□□□ 1.42
UBE2B-207ENST00000510021 PSME1Q06323 249 aa23.88■■□□□ 1.41
UBE2B-207ENST00000510021 PTGER2P43116 358 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-207ENST00000510021 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-207ENST00000510021 SYT17Q9BSW7 474 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-207ENST00000510021 NUP155O75694 1391 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-207ENST00000510021 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-207ENST00000510021 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
UBE2B-207ENST00000510021 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
UBE2B-207ENST00000510021 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 KIF1BO60333 1816 aa23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 DLC1Q96QB1 1528 aa23.81■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 ZBTB7AO95365 584 aa23.81■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
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