RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506024.5

PDE4D-214, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-214ENST00000506024 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-214ENST00000506024 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 HSPA2P54652 639 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 TATDN2Q93075 761 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 ABCA8O94911 1581 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 GPR37O15354 613 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 FAM161AQ3B820 660 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 TTC13Q8NBP0 860 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 GOLGA3Q08378 1498 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 C3orf80F5H4A9 247 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 RAPGEF3O95398 923 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 FECHP22830 423 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 WNT2BQ93097 391 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 NEO1Q92859 1461 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 ARID3CA6NKF2 412 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 POGZQ7Z3K3 1410 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-214ENST00000506024 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 FANCAO15360 1455 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 OATP04181 439 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 PTPN5P54829 565 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 EYA1Q99502 592 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 AKNAQ7Z591 1439 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 ATP10BO94823 1461 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 RNF40O75150 1001 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 BCAMP50895 628 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 MAP2K5Q13163 448 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 LRCH3Q96II8 777 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 RCCD1A6NED2 376 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 DNAJB2P25686 324 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 HCSTQ9UBK5 93 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 IRF6O14896 467 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 ZMYND10O75800 440 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 SLC4A3P48751 1232 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 BARGINQ6ZT62 677 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 PPP4CP60510 307 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 MLECQ14165 292 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 NLRP7Q8WX94 980 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 CCDC102AQ96A19 550 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-214ENST00000506024 RICTORQ6R327 1708 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 SLF2Q8IX21 1173 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 PHOX2BQ99453 314 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 WBP1LQ9NX94 342 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 PTPRTO14522 1441 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 STRCQ7RTU9 1775 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 HECW1Q76N89 1606 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 PRXQ9BXM0 1461 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-214ENST00000506024 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms