RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 BARGINQ6ZT62 677 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 PKD2L1Q9P0L9 805 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 ZMYND10O75800 440 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 ATP6V1AP38606 617 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 HLA-CQ95604 372 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 CTC1Q2NKJ3 1217 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 WFS1O76024 890 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 CD46P15529 392 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 GUCA2AQ02747 115 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 Q3C1V9 767 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 KDM4AO75164 1064 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 THAP11Q96EK4 314 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 GPCPD1Q9NPB8 672 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 CLCN1P35523 988 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 BRICD5Q6PL45 260 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 DACH1Q9UI36 760 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM66O15016 1216 aa5.58□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 AVPP01185 164 aa5.58□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 MSS51Q4VC12 460 aa5.58□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 SENP2Q9HC62 589 aa5.58□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 WNT7AO00755 349 aa5.57□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 NDUFV2P19404 249 aa5.57□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM32Q13049 653 aa5.57□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 SLC24A3Q9HC58 644 aa5.57□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 STK17AQ9UEE5 414 aa5.57□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.56□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.56□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.56□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 HOXA2O43364 376 aa5.55□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 SPIRE2Q8WWL2 714 aa5.55□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.55□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 AK7Q96M32 723 aa5.55□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHGC3Q9UN70 934 aa5.55□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 MS4A1P11836 297 aa5.54□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 SMPD1P17405 629 aa5.54□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 AMHR2Q16671 573 aa5.54□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 PARP9Q8IXQ6 854 aa5.54□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 KIFC2Q96AC6 838 aa5.54□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.54□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 MOXD2PA6NHM9 499 aa5.53□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 J3QL48 77 aa5.53□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 BCANQ96GW7 911 aa5.53□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM47Q96LD4 638 aa5.53□□□□□ -1.52
PDE4D-211ENST00000504624 FDX1P10109 184 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 USP46P62068 366 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 PDE4DQ08499 809 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 SLC16A10Q8TF71 515 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 C6orf229H3BNL8 230 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 ALDH1A1P00352 501 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 MMP16P51512 607 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 HPS1Q92902 700 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 WNT7BP56706 349 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 WIPF1O43516 503 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 EHBP1Q8NDI1 1231 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 JUNDP17535 347 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 CABLES1Q8TDN4 633 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-211ENST00000504624 RIC3Q7Z5B4 369 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 RETREG3Q86VR2 466 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 PRR7Q8TB68 274 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 IRF7Q92985 503 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 NUDT12Q9BQG2 462 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 SPTLC1O15269 473 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 BMP1P13497 986 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 HRCP23327 699 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 SKOR1P84550 965 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
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