RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 PTCH1Q13635 1447 aa16.13■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.13■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCDC125Q86Z20 511 aa16.09■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 ORAI2Q96SN7 254 aa16.09■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.09■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIF1BO60333 1816 aa16.08■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.08■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLTCL1P53675 1640 aa16.07■□□□□ 0.16
CD27-AS1-204ENST00000504270 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CD27-AS1-204ENST00000504270 MYOM2P54296 1465 aa16.06■□□□□ 0.16
CD27-AS1-204ENST00000504270 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.05■□□□□ 0.16
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRP5O75197 1615 aa16.05■□□□□ 0.16
CD27-AS1-204ENST00000504270 GLI3P10071 1580 aa16.03■□□□□ 0.16
CD27-AS1-204ENST00000504270 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CD27-AS1-204ENST00000504270 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.02■□□□□ 0.16
CD27-AS1-204ENST00000504270 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.02■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 PXDNQ92626 1479 aa16.01■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.99■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.99■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 RGL3Q3MIN7 710 aa15.98■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.98■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.98■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CD27-AS1-204ENST00000504270 PPLO60437 1756 aa15.95■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP32Q8NFA0 1604 aa15.95■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.95■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.95■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.95■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.94■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLIT2O94813 1529 aa15.94■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 FOXO3O43524 673 aa15.94■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 NUTM2FA1L443 756 aa15.91■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.91■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIF1AQ12756 1690 aa15.91■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.91■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.91■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 ABCA3Q99758 1704 aa15.9■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.9■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 NEUROD1Q13562 356 aa15.89■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLEKHG5O94827 1062 aa15.87■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.87■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.87■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.87■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 IFT172Q9UG01 1749 aa15.86■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.86■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.85■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.85■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 BAG6P46379 1132 aa15.85■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 VPS72Q15906 364 aa15.85■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.85■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A0G2JS52 829 aa15.84■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 MYT1Q01538 1121 aa15.84■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.84■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 STK26Q9P289 416 aa15.84■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 NRAPQ86VF7 1730 aa15.83■□□□□ 0.13
CD27-AS1-204ENST00000504270 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.83■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.82■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.82■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.82■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.81■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.81■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 TECPR2O15040 1411 aa15.8■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.79■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 STAC3Q96MF2 364 aa15.77■□□□□ 0.12
CD27-AS1-204ENST00000504270 PSME1Q06323 249 aa15.76■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.76■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM182BQ5T319 152 aa15.75■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.75■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.75■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 TONSLQ96HA7 1378 aa15.75■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM83GA6ND36 823 aa15.74■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 SBNO1A3KN83 1393 aa15.74■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 ARHGEF10O15013 1369 aa15.74■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 ABCC11Q96J66 1382 aa15.74■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.73■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.73■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADGRB2O60241 1585 aa15.73■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.73■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.72■□□□□ 0.11
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms