RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.06■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 POGKQ9P215 609 aa19.05■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.05■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.04■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGRB1O14514 1584 aa19.03■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.03■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 PTCH1Q13635 1447 aa19.02■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.02■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 MSH6P52701 1360 aa19.02■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCC11Q96J66 1382 aa19.02■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 PRAM1Q96QH2 718 aa19.01■□□□□ 0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.01■□□□□ 0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 SLAIN2Q9P270 581 aa19■□□□□ 0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.99■□□□□ 0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.99■□□□□ 0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TECPR2O15040 1411 aa18.99■□□□□ 0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.98■□□□□ 0.63
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PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.97■□□□□ 0.63
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PGGT1B-204ENST00000503638 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.95■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 DLC1Q96QB1 1528 aa18.95■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.94■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.94■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 SIRT1Q96EB6 747 aa18.93■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.92■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.92■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.91■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PGGT1B-204ENST00000503638 NUTM2FA1L443 756 aa18.89■□□□□ 0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 JCADQ9P266 1359 aa18.89■□□□□ 0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 DCCP43146 1447 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 USP47Q96K76 1375 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 PHLPP1O60346 1717 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.85■□□□□ 0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.85■□□□□ 0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 LRP6O75581 1613 aa18.83■□□□□ 0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.81■□□□□ 0.6
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PGGT1B-204ENST00000503638 MST1RQ04912 1400 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.8■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CDK19Q9BWU1 502 aa18.8■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGRB2O60241 1585 aa18.8■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 EVC2Q86UK5 1308 aa18.79■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.79■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf167Q5SNV9 1468 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 FMN2Q9NZ56 1722 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 BRINP3Q76B58 766 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CABP2Q9NPB3 220 aa18.77■□□□□ 0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 ORAI2Q96SN7 254 aa18.76■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKARQ7Z5J8 1434 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 TMF1P82094 1093 aa18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC24A1O60721 1099 aa18.71■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.71■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.71■□□□□ 0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 TESK2Q96S53 571 aa18.7■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXO3O43524 673 aa18.69■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 RXRBP28702 533 aa18.69■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 TMC1Q8TDI8 760 aa18.69■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP7BP35670 1465 aa18.69■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 USP32Q8NFA0 1604 aa18.68■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC61Q9Y6R9 512 aa18.68■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa18.67■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 SHPRHQ149N8 1683 aa18.67■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 ITSN1Q15811 1721 aa18.67■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 CDCA8Q53HL2 280 aa18.67■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.67■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.67■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF1AQ12756 1690 aa18.66■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 PSME1Q06323 249 aa18.66■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 AFF2P51816 1311 aa18.65■□□□□ 0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 CABP1Q9NZU7 370 aa18.64■□□□□ 0.57
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