RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.1□□□□□ -0.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 FDX1P10109 184 aa9.09□□□□□ -0.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q3C1V9 767 aa9.09□□□□□ -0.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.09□□□□□ -0.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.08□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.07□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 C6orf229H3BNL8 230 aa9.06□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.06□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.05□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.05□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.04□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM117AQ9C073 453 aa9.04□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.03□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 NEUROD2Q15784 382 aa9.03□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 MSS51Q4VC12 460 aa9.03□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.03□□□□□ -0.96
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.02□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.02□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC19A1P41440 591 aa9.01□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRR20EP86478 221 aa9.01□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRR20CP86479 221 aa9.01□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRR20DP86480 221 aa9.01□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRR20BP86481 221 aa9.01□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRR20AP86496 221 aa9.01□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.01□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.01□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.01□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPTLC1O15269 473 aa9□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPRYD7Q5W111 196 aa9□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 RETREG3Q86VR2 466 aa9□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.99□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 MMP16P51512 607 aa8.98□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTMR2Q13614 643 aa8.98□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF787Q6DD87 383 aa8.98□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.98□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRR7Q8TB68 274 aa8.98□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.97□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 QPCTQ16769 361 aa8.97□□□□□ -0.97
TIMMDC1-209ENST00000498399 JUNDP17535 347 aa8.96□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 HRCP23327 699 aa8.96□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.96□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.96□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 DGAT1O75907 488 aa8.95□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 GJA5P36382 358 aa8.95□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL27Q8NEV9 243 aa8.95□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.95□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYT1Q01538 1121 aa8.94□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSC1Q92574 1164 aa8.94□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.93□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFAP99D6REC4 459 aa8.93□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 GDF9O60383 454 aa8.93□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.93□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKDCCQ504Y2 493 aa8.92□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.92□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 FOXC1Q12948 553 aa8.91□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNFRSF10AO00220 468 aa8.9□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 LILRB3O75022 631 aa8.9□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPIAP49247 311 aa8.9□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.9□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIM32Q13049 653 aa8.89□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.88□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTPRNQ16849 979 aa8.87□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.87□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTHP32929 405 aa8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 DESI1Q6ICB0 168 aa8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM187AA6NFU0 413 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 LYPD8Q6UX82 237 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAP10Q9P2G4 905 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCNH2Q12809 1159 aa8.83□□□□□ -1
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC01559Q495D7 138 aa8.83□□□□□ -1
TIMMDC1-209ENST00000498399 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.83□□□□□ -1
TIMMDC1-209ENST00000498399 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155 ms