RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 C14orf37Q86TY3 774 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 MSH6P52701 1360 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 CDCA8Q53HL2 280 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 EVC2Q86UK5 1308 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 TMF1P82094 1093 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 TESK2Q96S53 571 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 ATF3P18847 181 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 CDK19Q9BWU1 502 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 CERKQ8TCT0 537 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDSP1-215ENST00000498160 ITSN1Q15811 1721 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDSP1-215ENST00000498160 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDSP1-215ENST00000498160 TOM1O60784 492 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDSP1-215ENST00000498160 MST1RQ04912 1400 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDSP1-215ENST00000498160 ATP7BP35670 1465 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDSP1-215ENST00000498160 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDSP1-215ENST00000498160 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 CABP2Q9NPB3 220 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 KIF1AQ12756 1690 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 SLAIN2Q9P270 581 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 USP32Q8NFA0 1604 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 CCDC7Q96M83 1385 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-215ENST00000498160 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.33■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 NUTM2FA1L443 756 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 TMC1Q8TDI8 760 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 MYOM1P52179 1685 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 CABP1Q9NZU7 370 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 BRINP3Q76B58 766 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 ORAI2Q96SN7 254 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 AKAP12Q02952 1782 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 ACEP12821 1306 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 PSME1Q06323 249 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1W2PP64 1363 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 USP6P35125 1406 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 FOXO3O43524 673 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 PIP4K2BP78356 416 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 PANK3Q9H999 370 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 SBNO1A3KN83 1393 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 PXDNQ92626 1479 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 PHLPP1O60346 1717 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 SSH2Q76I76 1423 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.09■■□□□ 1.45
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