RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495341.5

LMNA-215, Transcript of lamin A/C, humanhuman

TSL 5

Gene LMNA, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNA-215ENST00000495341 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.39■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.38■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 ABCC11Q96J66 1382 aa24.37■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 MYOM2P54296 1465 aa24.36■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.35■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.35■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.34■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.33■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 LAMC1P11047 1609 aa24.33■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
LMNA-215ENST00000495341 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
LMNA-215ENST00000495341 NUTM2FA1L443 756 aa24.32■■□□□ 1.48
LMNA-215ENST00000495341 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.32■■□□□ 1.48
LMNA-215ENST00000495341 AFF2P51816 1311 aa24.32■■□□□ 1.48
LMNA-215ENST00000495341 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
LMNA-215ENST00000495341 C8orf37Q96NL8 207 aa24.3■■□□□ 1.48
LMNA-215ENST00000495341 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.3■■□□□ 1.48
LMNA-215ENST00000495341 ADAMTS2O95450 1211 aa24.27■■□□□ 1.48
LMNA-215ENST00000495341 HRCP23327 699 aa24.26■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 RXRBP28702 533 aa24.26■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 FOXO3O43524 673 aa24.25■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 SIRT1Q96EB6 747 aa24.25■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.24■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.23■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 PRAM1Q96QH2 718 aa24.23■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.22■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 PXDNQ92626 1479 aa24.22■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 NGLY1Q96IV0 654 aa24.22■■□□□ 1.47
LMNA-215ENST00000495341 POGKQ9P215 609 aa24.2■■□□□ 1.46
LMNA-215ENST00000495341 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
LMNA-215ENST00000495341 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
LMNA-215ENST00000495341 DLC1Q96QB1 1528 aa24.18■■□□□ 1.46
LMNA-215ENST00000495341 KIF1AQ12756 1690 aa24.18■■□□□ 1.46
LMNA-215ENST00000495341 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.17■■□□□ 1.46
LMNA-215ENST00000495341 ADGRB1O14514 1584 aa24.16■■□□□ 1.46
LMNA-215ENST00000495341 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
LMNA-215ENST00000495341 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 STAC3Q96MF2 364 aa24.14■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 USP21Q9UK80 565 aa24.14■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.13■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.12■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.1■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 RGS12O14924 1447 aa24.1■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 ADGRB2O60241 1585 aa24.09■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 PSME1Q06323 249 aa24.08■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
LMNA-215ENST00000495341 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.08■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.06■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.06■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 PLEKHG5O94827 1062 aa24.04■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.04■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 USP32Q8NFA0 1604 aa24.03■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 ATRNO75882 1429 aa24.02■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 SBNO1A3KN83 1393 aa24.02■■□□□ 1.44
LMNA-215ENST00000495341 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.01■■□□□ 1.43
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LMNA-215ENST00000495341 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
LMNA-215ENST00000495341 BCL9LQ86UU0 1499 aa24■■□□□ 1.43
LMNA-215ENST00000495341 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.99■■□□□ 1.43
LMNA-215ENST00000495341 ARHGEF10O15013 1369 aa23.99■■□□□ 1.43
LMNA-215ENST00000495341 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
LMNA-215ENST00000495341 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.98■■□□□ 1.43
LMNA-215ENST00000495341 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.97■■□□□ 1.43
LMNA-215ENST00000495341 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.94■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 SLIT2O94813 1529 aa23.94■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.93■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.92■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 ATP7BP35670 1465 aa23.9■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.9■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 ABCA3Q99758 1704 aa23.9■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
LMNA-215ENST00000495341 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 CDK19Q9BWU1 502 aa23.88■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.87■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 ITSN1Q15811 1721 aa23.87■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 ALS2Q96Q42 1657 aa23.86■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 GLI3P10071 1580 aa23.85■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.85■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.84■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.84■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 NEUROD1Q13562 356 aa23.83■■□□□ 1.41
LMNA-215ENST00000495341 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
LMNA-215ENST00000495341 FAM83GA6ND36 823 aa23.82■■□□□ 1.4
LMNA-215ENST00000495341 VPS72Q15906 364 aa23.82■■□□□ 1.4
LMNA-215ENST00000495341 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.81■■□□□ 1.4
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