RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491843.2

ZNF638-222, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-222	ENST00000491843	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	MSS51	Q4VC12	460 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	SLC19A1	P41440	591 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNF638-222	ENST00000491843	MMP16	P51512	607 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	SPTLC1	O15269	473 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	JUND	P17535	347 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	MTMR2	Q13614	643 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	GFRA3	O60609	400 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	GJA5	P36382	358 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF638-222	ENST00000491843	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	HRC	P23327	699 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	RPIA	P49247	311 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	QPCT	Q16769	361 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	CFAP99	D6REC4	459 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	TNFRSF10A	O00220	468 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF638-222	ENST00000491843	FOXC1	Q12948	553 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843		Q6ZNB5	142 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	TSC1	Q92574	1164 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	LILRB3	O75022	631 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	TRIM32	Q13049	653 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	GDF9	O60383	454 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	PTPRN	Q16849	979 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	DESI1	Q6ICB0	168 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF638-222	ENST00000491843	PRR20E	P86478	221 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	PRR20C	P86479	221 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	PRR20D	P86480	221 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	PRR20B	P86481	221 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	PRR20A	P86496	221 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	CTH	P32929	405 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	SKOR1	P84550	965 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	MAP10	Q9P2G4	905 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	WNT7A	O00755	349 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	LCE2B	O14633	110 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	BAP1	Q92560	729 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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