RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 JMYQ8N9B5 988 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 MAP3K13O43283 966 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 KCNQ2O43526 872 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 ADAMTS2O95450 1211 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 IFNL1Q8IU54 200 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 PSEN1P49768 467 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 KIF12Q96FN5 646 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 PHF12Q96QT6 1004 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 KIF14Q15058 1648 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 IGF1RP08069 1367 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 AFAP1Q8N556 730 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 POTEIP0CG38 1075 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 KLRG1Q96E93 195 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.59□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 DLL1O00548 723 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 E2F4Q16254 413 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 WDR90Q96KV7 1748 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 TIAM1Q13009 1591 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 ATP7AQ04656 1500 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 HTRA3P83110 453 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 MYOM1P52179 1685 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 A0A0C4DFX4 3053 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 SYT17Q9BSW7 474 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 MSH6P52701 1360 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 CABP2Q9NPB3 220 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 ATP10DQ9P241 1426 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 CACNA1AO00555 2505 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 TNRQ92752 1358 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 SEMA3EO15041 775 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 ZMYND10O75800 440 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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SHQ1-208ENST00000482785 MFRPQ9BY79 579 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 A2MP01023 1474 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 GLI3P10071 1580 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 RGS19P49795 217 aa6.53□□□□□ -1.36
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SHQ1-208ENST00000482785 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 TRPC6Q9Y210 931 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-208ENST00000482785 USP19O94966 1318 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 GPR162Q16538 588 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 ABCC3O15438 1527 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 DLC1Q96QB1 1528 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 KCNA6P17658 529 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 BARGINQ6ZT62 677 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 DISP2A7MBM2 1401 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 KIF3CO14782 793 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 PPP1R37O75864 691 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 LTKP29376 864 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 PTGER2P43116 358 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 NLRP6P59044 892 aa6.48□□□□□ -1.37
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