RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482269.1

TTLL3-227, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 882 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-227ENST00000482269 DCCP43146 1447 aa25.32■■□□□ 1.64
TTLL3-227ENST00000482269 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.32■■□□□ 1.64
TTLL3-227ENST00000482269 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.31■■□□□ 1.64
TTLL3-227ENST00000482269 ATF3P18847 181 aa25.3■■□□□ 1.64
TTLL3-227ENST00000482269 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.3■■□□□ 1.64
TTLL3-227ENST00000482269 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
TTLL3-227ENST00000482269 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TTLL3-227ENST00000482269 FBXO41Q8TF61 875 aa25.26■■□□□ 1.63
TTLL3-227ENST00000482269 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.26■■□□□ 1.63
TTLL3-227ENST00000482269 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TTLL3-227ENST00000482269 ADGRB2O60241 1585 aa25.22■■□□□ 1.63
TTLL3-227ENST00000482269 SLAIN2Q9P270 581 aa25.22■■□□□ 1.63
TTLL3-227ENST00000482269 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.22■■□□□ 1.63
TTLL3-227ENST00000482269 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TTLL3-227ENST00000482269 PIP4K2BP78356 416 aa25.19■■□□□ 1.62
TTLL3-227ENST00000482269 MST1RQ04912 1400 aa25.19■■□□□ 1.62
TTLL3-227ENST00000482269 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.18■■□□□ 1.62
TTLL3-227ENST00000482269 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TTLL3-227ENST00000482269 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TTLL3-227ENST00000482269 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TTLL3-227ENST00000482269 USP47Q96K76 1375 aa25.14■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.14■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.13■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.12■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.1■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.09■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.09■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 NUTM2FA1L443 756 aa25.09■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 CDK19Q9BWU1 502 aa25.09■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 BRINP3Q76B58 766 aa25.08■■□□□ 1.61
TTLL3-227ENST00000482269 EVC2Q86UK5 1308 aa25.08■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 SLC24A1O60721 1099 aa25.07■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 USP32Q8NFA0 1604 aa25.05■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.05■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 ORAI2Q96SN7 254 aa25.04■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 TESK2Q96S53 571 aa25.03■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 ITSN1Q15811 1721 aa25.03■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 KIF1AQ12756 1690 aa25.02■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 ATP7BP35670 1465 aa25.02■■□□□ 1.6
TTLL3-227ENST00000482269 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.01■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 CABP2Q9NPB3 220 aa25■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.99■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.99■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 PHLPP1O60346 1717 aa24.98■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.98■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.97■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 HSPA1LP34931 641 aa24.97■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 TMF1P82094 1093 aa24.96■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TTLL3-227ENST00000482269 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.94■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.94■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 FOXO3O43524 673 aa24.93■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.92■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.92■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.91■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 CDCA8Q53HL2 280 aa24.91■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.9■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TTLL3-227ENST00000482269 PXDNQ92626 1479 aa24.88■■□□□ 1.57
TTLL3-227ENST00000482269 PSME1Q06323 249 aa24.87■■□□□ 1.57
TTLL3-227ENST00000482269 CABP1Q9NZU7 370 aa24.87■■□□□ 1.57
TTLL3-227ENST00000482269 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TTLL3-227ENST00000482269 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.85■■□□□ 1.57
TTLL3-227ENST00000482269 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TTLL3-227ENST00000482269 ACEP12821 1306 aa24.85■■□□□ 1.57
TTLL3-227ENST00000482269 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.83■■□□□ 1.57
TTLL3-227ENST00000482269 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TTLL3-227ENST00000482269 TMC1Q8TDI8 760 aa24.82■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 JCADQ9P266 1359 aa24.81■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 SBNO1A3KN83 1393 aa24.8■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 AKAP12Q02952 1782 aa24.8■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 SHPRHQ149N8 1683 aa24.78■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.78■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.77■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TTLL3-227ENST00000482269 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.76■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.76■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 USP6P35125 1406 aa24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.74■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.74■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 ARHGEF10O15013 1369 aa24.73■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TTLL3-227ENST00000482269 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms