RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481477.5

SETD4-215, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SETD4, Length 2,761 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-215ENST00000481477 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 IFT172Q9UG01 1749 aa16■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.99■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 MS4A1P11836 297 aa15.99■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 SKAP1Q86WV1 359 aa15.98■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 RICTORQ6R327 1708 aa15.98■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 SLC4A3P48751 1232 aa15.98■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 MORC1Q86VD1 984 aa15.98■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.97■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.97■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.97■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 PPLO60437 1756 aa15.96■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.96■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa15.96■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.95■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.94■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 PRAM1Q96QH2 718 aa15.94■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 PDE3BQ13370 1112 aa15.94■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 POGKQ9P215 609 aa15.94■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 ADGRB1O14514 1584 aa15.94■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.93■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 CRBNQ96SW2 442 aa15.93■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.93■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.93■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.92■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.91■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.91■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 GLI2P10070 1586 aa15.91■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 EVC2Q86UK5 1308 aa15.91■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 MTHFSP49914 203 aa15.91■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 GOLGA2Q08379 1002 aa15.9■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.9■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.9■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 PIK3C2BO00750 1634 aa15.9■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.9■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.9■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.9■□□□□ 0.14
SETD4-215ENST00000481477 DIP2BQ9P265 1576 aa15.89■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 FBLN1P23142 703 aa15.87■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.87■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.86■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.86■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.86■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 BCAR3O75815 825 aa15.86■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.85■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.84■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.134e-7■■■■□ 22.6
SETD4-215ENST00000481477 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.84■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.84■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 SLFN5Q08AF3 891 aa15.83■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 ZNF521Q96K83 1311 aa15.83■□□□□ 0.13
SETD4-215ENST00000481477 A0A1W2PP64 1363 aa15.83■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 CABP1Q9NZU7 370 aa15.82■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 CDK19Q9BWU1 502 aa15.82■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.81■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.81■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.81■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.81■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 NUTM2FA1L443 756 aa15.8■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.8■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 WWC1Q8IX03 1113 aa15.79■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.79■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 CFAP53Q96M91 514 aa15.77■□□□□ 0.12
SETD4-215ENST00000481477 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 PTPRMP28827 1452 aa15.76■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 FYB1O15117 783 aa15.76■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 INSRP06213 1382 aa15.76■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.75■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 RUNDC1Q96C34 613 aa15.75■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 ALKQ9UM73 1620 aa15.75■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 E9PSI1 815 aa15.75■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 C8orf34Q49A92 452 aa15.74■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.74■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.74■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 ZMYM3Q14202 1370 aa15.74■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.74■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.74■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 PANK1Q8TE04 598 aa15.74■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 TNNQ9UQP3 1299 aa15.74■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 ZMYND15Q9H091 742 aa15.73■□□□□ 0.11
SETD4-215ENST00000481477 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms