RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480472.5

TTLL4-218, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

TSL 4

Gene TTLL4, Length 765 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-218ENST00000480472 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.84□□□□□ -0.67
TTLL4-218ENST00000480472 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
TTLL4-218ENST00000480472 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.84□□□□□ -0.67
TTLL4-218ENST00000480472 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.82□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 FOXO3O43524 673 aa10.82□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 VPS72Q15906 364 aa10.82□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.82□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.82□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.81□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.81□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 PXDNQ92626 1479 aa10.81□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.8□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.8□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 VPS8Q8N3P4 1428 aa10.79□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 ADGRL2O95490 1459 aa10.79□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.78□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTLL4-218ENST00000480472 FAM182BQ5T319 152 aa10.77□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.76□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.76□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 E9PCH4 1651 aa10.76□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.75□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 A0A0G2JS52 829 aa10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 MYT1Q01538 1121 aa10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 DISP2A7MBM2 1401 aa10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 NUTM2FA1L443 756 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 FAM83GA6ND36 823 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 HFM1A2PYH4 1435 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 PLEKHG5O94827 1062 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-218ENST00000480472 USP32Q8NFA0 1604 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 NUP155O75694 1391 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 C1QTNF8P60827 252 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 KCNQ2O43526 872 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 TRIM37O94972 964 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 SPON1Q9HCB6 807 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 APBA3O96018 575 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 BTG4Q9NY30 223 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 UTRNP46939 3433 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 NINLQ9Y2I6 1382 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 NAIPQ13075 1403 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 PARD3Q8TEW0 1356 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 NBPF8Q3BBV2 869 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 NBPF14Q5TI25 921 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-218ENST00000480472 PSME1Q06323 249 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 APLP2Q06481 763 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 SBNO1A3KN83 1393 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 STK26Q9P289 416 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 ROCK1Q13464 1354 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 ARHGEF10O15013 1369 aa10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 CLTCL1P53675 1640 aa10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 CEP350Q5VT06 3117 aa10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.6□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.59□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 NRAPQ86VF7 1730 aa10.59□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 ADGRB2O60241 1585 aa10.59□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa10.58□□□□□ -0.71
TTLL4-218ENST00000480472 PTGER2P43116 358 aa10.58□□□□□ -0.72
TTLL4-218ENST00000480472 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.58□□□□□ -0.72
TTLL4-218ENST00000480472 TECPR2O15040 1411 aa10.58□□□□□ -0.72
TTLL4-218ENST00000480472 ABCC11Q96J66 1382 aa10.57□□□□□ -0.72
TTLL4-218ENST00000480472 SYT17Q9BSW7 474 aa10.57□□□□□ -0.72
TTLL4-218ENST00000480472 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.57□□□□□ -0.72
TTLL4-218ENST00000480472 KIF1AQ12756 1690 aa10.57□□□□□ -0.72
TTLL4-218ENST00000480472 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms