RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 CDK19Q9BWU1 502 aa24.95■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 DLC1Q96QB1 1528 aa24.95■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 EVC2Q86UK5 1308 aa24.95■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 TMC1Q8TDI8 760 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 TECPR2O15040 1411 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 NUTM2FA1L443 756 aa24.93■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 CDCA8Q53HL2 280 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 DIP2AQ14689 1571 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 CPS1P31327 1500 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 SIRT1Q96EB6 747 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4B-217ENST00000475693 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.89■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 ANP32CO43423 234 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 SLC24A1O60721 1099 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 STRCQ7RTU9 1775 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 MYOM1P52179 1685 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 PIK3R4Q99570 1358 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4B-217ENST00000475693 PTCH1Q13635 1447 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-217ENST00000475693 CABP1Q9NZU7 370 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-217ENST00000475693 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-217ENST00000475693 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-217ENST00000475693 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.8■■□□□ 1.56
ATG4B-217ENST00000475693 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
ATG4B-217ENST00000475693 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-217ENST00000475693 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC184Q52MB2 194 aa24.76■■□□□ 1.55
ATG4B-217ENST00000475693 C14orf37Q86TY3 774 aa24.76■■□□□ 1.55
ATG4B-217ENST00000475693 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-217ENST00000475693 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-217ENST00000475693 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-217ENST00000475693 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.73■■□□□ 1.55
ATG4B-217ENST00000475693 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PP64 1363 aa24.71■■□□□ 1.55
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 ATP7BP35670 1465 aa24.68■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.68■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 NWD1Q149M9 1564 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRB2O60241 1585 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM94Q12767 1356 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
ATG4B-217ENST00000475693 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.63■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 USP32Q8NFA0 1604 aa24.63■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.63■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 ACEP12821 1306 aa24.61■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.59■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.59■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.59■■□□□ 1.53
ATG4B-217ENST00000475693 CCER2I3L3R5 266 aa24.58■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 ORAI2Q96SN7 254 aa24.58■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.58■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.58■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 RALBP1Q15311 655 aa24.57■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.57■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.56■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 MRS2Q9HD23 443 aa24.56■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.55■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 FYB1O15117 783 aa24.55■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.55■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.55■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 FBLN1P23142 703 aa24.54■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 NME9Q86XW9 330 aa24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.52■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 MORC1Q86VD1 984 aa24.52■■□□□ 1.52
ATG4B-217ENST00000475693 ATF3P18847 181 aa24.51■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 PPP2R1AP30153 589 aa24.51■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 MYT1Q01538 1121 aa24.5■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.5■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.49■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.48■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.48■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 FOXO3O43524 673 aa24.47■■□□□ 1.51
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms