RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.25□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.25□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 RLBP1P12271 317 aa13.25□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 AFAP1Q8N556 730 aa13.25□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.25□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.25□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 TNNQ9UQP3 1299 aa13.25□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 AAMPQ13685 434 aa13.24□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.24□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.24□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 ATP7AQ04656 1500 aa13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 RUNDC1Q96C34 613 aa13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 NSD3Q9BZ95 1437 aa13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 NEUROD2Q15784 382 aa13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 USP32Q8NFA0 1604 aa13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 KANK1Q14678 1352 aa13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 TBC1D2Q9BYX2 928 aa13.23□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.22□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.22□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 WDR63Q8IWG1 891 aa13.21□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13.21□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.21□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 MORC1Q86VD1 984 aa13.2□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.2□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.2□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 RSPH6AQ9H0K4 717 aa13.19□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.19□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC27Q2M243 656 aa13.19□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 ADGRB2O60241 1585 aa13.18□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 PPLO60437 1756 aa13.18□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 KIF3BO15066 747 aa13.18□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 ADGRB3O60242 1522 aa13.17□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.17□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 MVPQ14764 893 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 NOS1P29475 1434 aa13.16□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 ADGRB1O14514 1584 aa13.16□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 MTHFSP49914 203 aa13.15□□□□□ -0.3
LINC00886-201ENST00000472943 FANCAO15360 1455 aa13.14□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 ADGRL1O94910 1474 aa13.14□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 FSD2A1L4K1 749 aa13.14□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 MCM4P33991 863 aa13.14□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.14□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.14□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa13.14□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.13□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.13□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa13.13□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.13□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.12□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 CFAP53Q96M91 514 aa13.12□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.11□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.1□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.1□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 ARXQ96QS3 562 aa13.1□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 TRIM27P14373 513 aa13.09□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 PANK2Q9BZ23 570 aa13.09□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 GLI2P10070 1586 aa13.09□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 CD109Q6YHK3 1445 aa13.09□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 NSD2O96028 1365 aa13.09□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
LINC00886-201ENST00000472943 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.08□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.08□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.08□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 TRAK2O60296 914 aa13.08□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.08□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 SMC5Q8IY18 1101 aa13.07□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 DDX19BQ9UMR2 479 aa13.07□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 SSH1Q8WYL5 1049 aa13.06□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 PLEKHF1Q96S99 279 aa13.06□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 DDIT3P35638 169 aa13.06□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa13.06□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 ITPRIPQ8IWB1 547 aa13.06□□□□□ -0.32
LINC00886-201ENST00000472943 NPATQ14207 1427 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms