RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468454.1

PTPRN-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-212ENST00000468454 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-212ENST00000468454 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
PTPRN-212ENST00000468454 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-212ENST00000468454 HRCP23327 699 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-212ENST00000468454 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRN-212ENST00000468454 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-212ENST00000468454 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-212ENST00000468454 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-212ENST00000468454 PXDNQ92626 1479 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-212ENST00000468454 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRN-212ENST00000468454 NUP155O75694 1391 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRN-212ENST00000468454 FOXO3O43524 673 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRN-212ENST00000468454 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-212ENST00000468454 SLIT2O94813 1529 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-212ENST00000468454 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-212ENST00000468454 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRN-212ENST00000468454 NUTM2FA1L443 756 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-212ENST00000468454 ROCK1Q13464 1354 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-212ENST00000468454 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 PLEKHG5O94827 1062 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 CLTCL1P53675 1640 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 BAG6P46379 1132 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 VPS72Q15906 364 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-212ENST00000468454 YY1P25490 414 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-212ENST00000468454 FAM182BQ5T319 152 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-212ENST00000468454 USP32Q8NFA0 1604 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-212ENST00000468454 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-212ENST00000468454 HFM1A2PYH4 1435 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-212ENST00000468454 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-212ENST00000468454 A0A0G2JS52 829 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-212ENST00000468454 MYT1Q01538 1121 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-212ENST00000468454 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-212ENST00000468454 ITGAEP38570 1179 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 NAIPQ13075 1403 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 FAM83GA6ND36 823 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 STK26Q9P289 416 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 KIF1BO60333 1816 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRN-212ENST00000468454 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-212ENST00000468454 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-212ENST00000468454 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-212ENST00000468454 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-212ENST00000468454 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-212ENST00000468454 ABCA3Q99758 1704 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-212ENST00000468454 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-212ENST00000468454 NRAPQ86VF7 1730 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 BTG4Q9NY30 223 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 PPLO60437 1756 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 KIF1AQ12756 1690 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 DISP2A7MBM2 1401 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 TRIM37O94972 964 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-212ENST00000468454 PSME1Q06323 249 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 TECPR2O15040 1411 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 SBNO1A3KN83 1393 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 UTRNP46939 3433 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 APBA3O96018 575 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 ABCC11Q96J66 1382 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-212ENST00000468454 ARHGEF10O15013 1369 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 IFT172Q9UG01 1749 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 RGL3Q3MIN7 710 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 RREB1Q92766 1687 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 ADGRB2O60241 1585 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 SPON1Q9HCB6 807 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-212ENST00000468454 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
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