RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458666.1

LMCD1-AS1-207, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 581 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.24■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 POGKQ9P215 609 aa15.23■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.22■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 C8orf37Q96NL8 207 aa15.22■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PPLO60437 1756 aa15.21■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LRP6O75581 1613 aa15.21■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TECPR2O15040 1411 aa15.21■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FOXO3O43524 673 aa15.21■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ADAMTS2O95450 1211 aa15.21■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SIRT1Q96EB6 747 aa15.21■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PRAM1Q96QH2 718 aa15.21■□□□□ 0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.21■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.21■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 STAC3Q96MF2 364 aa15.2■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MYOM2P54296 1465 aa15.2■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 AFF2P51816 1311 aa15.19■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RXRBP28702 533 aa15.19■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NGLY1Q96IV0 654 aa15.19■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.19■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.18■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.16■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.15■□□□□ 0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SHPRHQ149N8 1683 aa15.14■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PSME1Q06323 249 aa15.13■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.13■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.12■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.12■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.12■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 USP21Q9UK80 565 aa15.11■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PLEKHG5O94827 1062 aa15.1■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 IFT172Q9UG01 1749 aa15.09■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.09■□□□□ 0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LAMC1P11047 1609 aa15.08■□□□□ 0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.08■□□□□ 0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PXDNQ92626 1479 aa15.08■□□□□ 0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DLC1Q96QB1 1528 aa15.07■□□□□ 0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.05■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.05■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ADGRB1O14514 1584 aa15.05■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.05■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NEUROD1Q13562 356 aa15.03■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ARHGEF10O15013 1369 aa15.02■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.02■□□□□ -0
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.01□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SBNO1A3KN83 1393 aa15.01□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CDK19Q9BWU1 502 aa15□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.99□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.99□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.99□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.99□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.99□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KIF1AQ12756 1690 aa14.99□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RGS12O14924 1447 aa14.99□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ATRNO75882 1429 aa14.97□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.96□□□□□ -0.01
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.96□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.95□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ADGRB2O60241 1585 aa14.95□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.95□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 A0A0G2JS52 829 aa14.93□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MYT1Q01538 1121 aa14.93□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FAM83GA6ND36 823 aa14.92□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 VPS72Q15906 364 aa14.91□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.91□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.91□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CABP2Q9NPB3 220 aa14.91□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.91□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ACEP12821 1306 aa14.91□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BTG4Q9NY30 223 aa14.9□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SLIT2O94813 1529 aa14.9□□□□□ -0.02
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ATP7BP35670 1465 aa14.89□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.89□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms