RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAMTS2O95450 1211 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 RXRBP28702 533 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 TECPR2O15040 1411 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PIK3C2GO75747 1445 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCC11Q96J66 1382 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NUTM2FA1L443 756 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NGLY1Q96IV0 654 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 LAMC1P11047 1609 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 IFT172Q9UG01 1749 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXO3O43524 673 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 SIRT1Q96EB6 747 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 USP21Q9UK80 565 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 PXDNQ92626 1479 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 MYOM2P54296 1465 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 RGS12O14924 1447 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAM1Q96QH2 718 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 POGKQ9P215 609 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 ATRNO75882 1429 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHG5O94827 1062 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 ADGRB1O14514 1584 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF1AQ12756 1690 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 DLC1Q96QB1 1528 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 HRCP23327 699 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 PSME1Q06323 249 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP4-206ENST00000446904 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SH3BP4-206ENST00000446904 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP4-206ENST00000446904 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP4-206ENST00000446904 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.06■□□□□ 0
SH3BP4-206ENST00000446904 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SH3BP4-206ENST00000446904 SBNO1A3KN83 1393 aa15.06■□□□□ 0
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.06■□□□□ 0
SH3BP4-206ENST00000446904 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SH3BP4-206ENST00000446904 STAC3Q96MF2 364 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-206ENST00000446904 SLIT2O94813 1529 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGEF10O15013 1369 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-206ENST00000446904 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP4-206ENST00000446904 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP4-206ENST00000446904 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP4-206ENST00000446904 USP32Q8NFA0 1604 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-206ENST00000446904 ADGRB2O60241 1585 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP4-206ENST00000446904 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 EP400Q96L91 3159 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM83GA6ND36 823 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 VPS72Q15906 364 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 GLI3P10071 1580 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-206ENST00000446904 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC125Q86Z20 511 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 CDK19Q9BWU1 502 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 BTG4Q9NY30 223 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCA3Q99758 1704 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP7BP35670 1465 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0G2JS52 829 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms