RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 STK26Q9P289 416 aa39.31■■■■□ 3.88
UPP1-208ENST00000436673 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
UPP1-208ENST00000436673 PIK3C2GO75747 1445 aa39.3■■■■□ 3.88
UPP1-208ENST00000436673 C8orf37Q96NL8 207 aa39.29■■■■□ 3.88
UPP1-208ENST00000436673 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.27■■■■□ 3.88
UPP1-208ENST00000436673 ABCC11Q96J66 1382 aa39.27■■■■□ 3.88
UPP1-208ENST00000436673 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.26■■■■□ 3.88
UPP1-208ENST00000436673 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
UPP1-208ENST00000436673 ESCO1Q5FWF5 840 aa39.23■■■■□ 3.87
UPP1-208ENST00000436673 ADAMTS2O95450 1211 aa39.21■■■■□ 3.87
UPP1-208ENST00000436673 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.2■■■■□ 3.87
UPP1-208ENST00000436673 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.19■■■■□ 3.86
UPP1-208ENST00000436673 NPHP3Q7Z494 1330 aa39.18■■■■□ 3.86
UPP1-208ENST00000436673 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
UPP1-208ENST00000436673 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
UPP1-208ENST00000436673 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.17■■■■□ 3.86
UPP1-208ENST00000436673 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP39.16■■■■□ 3.86
UPP1-208ENST00000436673 NGLY1Q96IV0 654 aa39.16■■■■□ 3.86
UPP1-208ENST00000436673 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
UPP1-208ENST00000436673 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.14■■■■□ 3.86
UPP1-208ENST00000436673 PXDNQ92626 1479 aa39.13■■■■□ 3.85
UPP1-208ENST00000436673 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
UPP1-208ENST00000436673 NUTM2FA1L443 756 aa39.12■■■■□ 3.85
UPP1-208ENST00000436673 FOXO3O43524 673 aa39.12■■■■□ 3.85
UPP1-208ENST00000436673 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
UPP1-208ENST00000436673 MYOM2P54296 1465 aa39.11■■■■□ 3.85
UPP1-208ENST00000436673 SIRT1Q96EB6 747 aa39.11■■■■□ 3.85
UPP1-208ENST00000436673 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.08■■■■□ 3.85
UPP1-208ENST00000436673 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
UPP1-208ENST00000436673 RGS12O14924 1447 aa39.06■■■■□ 3.84
UPP1-208ENST00000436673 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
UPP1-208ENST00000436673 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
UPP1-208ENST00000436673 FMN2Q9NZ56 1722 aa39.03■■■■□ 3.84
UPP1-208ENST00000436673 USP21Q9UK80 565 aa39.03■■■■□ 3.84
UPP1-208ENST00000436673 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
UPP1-208ENST00000436673 KIF1AQ12756 1690 aa38.95■■■■□ 3.83
UPP1-208ENST00000436673 PRAM1Q96QH2 718 aa38.94■■■■□ 3.82
UPP1-208ENST00000436673 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa38.92■■■■□ 3.82
UPP1-208ENST00000436673 ATRNO75882 1429 aa38.92■■■■□ 3.82
UPP1-208ENST00000436673 DLC1Q96QB1 1528 aa38.9■■■■□ 3.82
UPP1-208ENST00000436673 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP38.9■■■■□ 3.82
UPP1-208ENST00000436673 KRT28Q7Z3Y7 464 aa38.89■■■■□ 3.82
UPP1-208ENST00000436673 BCL9LQ86UU0 1499 aa38.88■■■■□ 3.81
UPP1-208ENST00000436673 PHF8Q9UPP1 1060 aa38.88■■■■□ 3.81
UPP1-208ENST00000436673 ADGRB1O14514 1584 aa38.87■■■■□ 3.81
UPP1-208ENST00000436673 HRCP23327 699 aa38.87■■■■□ 3.81
UPP1-208ENST00000436673 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
UPP1-208ENST00000436673 POGKQ9P215 609 aa38.85■■■■□ 3.81
UPP1-208ENST00000436673 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.81
UPP1-208ENST00000436673 DCAF11Q8TEB1 546 aa38.82■■■■□ 3.8
UPP1-208ENST00000436673 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa38.82■■■■□ 3.8
UPP1-208ENST00000436673 PSME1Q06323 249 aa38.8■■■■□ 3.8
UPP1-208ENST00000436673 TRAK1Q9UPV9 953 aa38.79■■■■□ 3.8
UPP1-208ENST00000436673 TNS3Q68CZ2 1445 aa38.79■■■■□ 3.8
UPP1-208ENST00000436673 ATAD2Q6PL18 1390 aa38.78■■■■□ 3.8
UPP1-208ENST00000436673 ANKARQ7Z5J8 1434 aa38.78■■■■□ 3.8
UPP1-208ENST00000436673 ADGRB2O60241 1585 aa38.78■■■■□ 3.8
UPP1-208ENST00000436673 STAC3Q96MF2 364 aa38.77■■■■□ 3.8
UPP1-208ENST00000436673 SBNO1A3KN83 1393 aa38.75■■■■□ 3.79
UPP1-208ENST00000436673 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
UPP1-208ENST00000436673 SLIT2O94813 1529 aa38.73■■■■□ 3.79
UPP1-208ENST00000436673 USP32Q8NFA0 1604 aa38.73■■■■□ 3.79
UPP1-208ENST00000436673 UNC5CLQ8IV45 518 aa38.72■■■■□ 3.79
UPP1-208ENST00000436673 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa38.71■■■■□ 3.79
UPP1-208ENST00000436673 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
UPP1-208ENST00000436673 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
UPP1-208ENST00000436673 CABLES1Q8TDN4 633 aa38.69■■■■□ 3.78
UPP1-208ENST00000436673 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
UPP1-208ENST00000436673 ARHGEF10O15013 1369 aa38.68■■■■□ 3.78
UPP1-208ENST00000436673 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
UPP1-208ENST00000436673 EP400Q96L91 3159 aa38.66■■■■□ 3.78
UPP1-208ENST00000436673 LMOD2Q6P5Q4 547 aa38.65■■■■□ 3.78
UPP1-208ENST00000436673 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
UPP1-208ENST00000436673 PRR36Q9H6K5 1346 aa38.63■■■■□ 3.78
UPP1-208ENST00000436673 RALGAPBQ86X10 1494 aa38.63■■■■□ 3.77
UPP1-208ENST00000436673 WASLO00401 505 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
UPP1-208ENST00000436673 PLEKHG5O94827 1062 aa38.62■■■■□ 3.77
UPP1-208ENST00000436673 TULP4Q9NRJ4 1543 aa38.61■■■■□ 3.77
UPP1-208ENST00000436673 GLI3P10071 1580 aa38.61■■■■□ 3.77
UPP1-208ENST00000436673 ABCA3Q99758 1704 aa38.58■■■■□ 3.77
UPP1-208ENST00000436673 GPRASP1Q5JY77 1395 aa38.56■■■■□ 3.76
UPP1-208ENST00000436673 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
UPP1-208ENST00000436673 VPS72Q15906 364 aa38.54■■■■□ 3.76
UPP1-208ENST00000436673 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
UPP1-208ENST00000436673 FAM83GA6ND36 823 aa38.51■■■■□ 3.76
UPP1-208ENST00000436673 PLCH1Q4KWH8 1693 aa38.51■■■■□ 3.76
UPP1-208ENST00000436673 NWD2Q9ULI1 1742 aa38.51■■■■□ 3.76
UPP1-208ENST00000436673 CCDC125Q86Z20 511 aa38.5■■■■□ 3.75
UPP1-208ENST00000436673 ALS2Q96Q42 1657 aa38.49■■■■□ 3.75
UPP1-208ENST00000436673 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
UPP1-208ENST00000436673 ATP7BP35670 1465 aa38.45■■■■□ 3.75
UPP1-208ENST00000436673 SEPT12Q8IYM1 358 aa38.44■■■■□ 3.74
UPP1-208ENST00000436673 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
UPP1-208ENST00000436673 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
UPP1-208ENST00000436673 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
UPP1-208ENST00000436673 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa38.4■■■■□ 3.74
UPP1-208ENST00000436673 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
UPP1-208ENST00000436673 CDK19Q9BWU1 502 aa38.39■■■■□ 3.74
UPP1-208ENST00000436673 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa38.39■■■■□ 3.74
UPP1-208ENST00000436673 BRWD3Q6RI45 1802 aa38.38■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms