RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.72■□□□□ 0.27
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOLGA2Q08379 1002 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MTHFSP49914 203 aa16.7■□□□□ 0.26
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF521Q96K83 1311 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SKAP1Q86WV1 359 aa16.68■□□□□ 0.26
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A1W2PP64 1363 aa16.66■□□□□ 0.26
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZFYVE9O95405 1425 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MSH5O43196 834 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTPRMP28827 1452 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDK19Q9BWU1 502 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CABP1Q9NZU7 370 aa16.63■□□□□ 0.25
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BCAR3O75815 825 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.61■□□□□ 0.25
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZMYM3Q14202 1370 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WWC1Q8IX03 1113 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AGLP35573 1532 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FYB1O15117 783 aa16.58■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CFAP53Q96M91 514 aa16.58■□□□□ 0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SHPRHQ149N8 1683 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RUNDC1Q96C34 613 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 METP08581 1390 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 REREQ9P2R6 1566 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABCC11Q96J66 1382 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUTM2FA1L443 756 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP32Q8NFA0 1604 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NSD2O96028 1365 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNRQ92752 1358 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PANK1Q8TE04 598 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNNQ9UQP3 1299 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NME9Q86XW9 330 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NLRP1Q9C000 1473 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LTKP29376 864 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COG6Q9Y2V7 657 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.46■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NGEFQ8N5V2 710 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.43■□□□□ 0.22
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