RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424519.1

MTM1-204, Transcript of myotubularin 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTM1, Length 361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1-204ENST00000424519 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.26■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.26■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 ADAMTS2O95450 1211 aa22.25■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 C8orf37Q96NL8 207 aa22.25■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 ABCC11Q96J66 1382 aa22.24■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 PIK3C2GO75747 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 RXRBP28702 533 aa22.23■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 FOXO3O43524 673 aa22.22■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 LAMC1P11047 1609 aa22.2■■□□□ 1.15
MTM1-204ENST00000424519 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 TECPR2O15040 1411 aa22.2■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 NGLY1Q96IV0 654 aa22.19■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.18■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.17■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.17■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 SIRT1Q96EB6 747 aa22.15■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.15■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.14■■□□□ 1.14
MTM1-204ENST00000424519 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 PRAM1Q96QH2 718 aa22.13■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 PXDNQ92626 1479 aa22.12■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.11■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 MYOM2P54296 1465 aa22.11■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.11■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 USP21Q9UK80 565 aa22.1■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.09■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.09■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 POGKQ9P215 609 aa22.08■■□□□ 1.13
MTM1-204ENST00000424519 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 HRCP23327 699 aa22.07■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 PLEKHG5O94827 1062 aa22.06■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.06■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 RGS12O14924 1447 aa22.05■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.05■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.03■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 ADGRB1O14514 1584 aa22.02■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
MTM1-204ENST00000424519 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.01■■□□□ 1.11
MTM1-204ENST00000424519 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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MTM1-204ENST00000424519 PSME1Q06323 249 aa21.98■■□□□ 1.11
MTM1-204ENST00000424519 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.98■■□□□ 1.11
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MTM1-204ENST00000424519 USP32Q8NFA0 1604 aa21.97■■□□□ 1.11
MTM1-204ENST00000424519 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.96■■□□□ 1.11
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MTM1-204ENST00000424519 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
MTM1-204ENST00000424519 STAC3Q96MF2 364 aa21.92■■□□□ 1.1
MTM1-204ENST00000424519 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.91■■□□□ 1.1
MTM1-204ENST00000424519 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
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MTM1-204ENST00000424519 SBNO1A3KN83 1393 aa21.89■■□□□ 1.1
MTM1-204ENST00000424519 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.89■■□□□ 1.09
MTM1-204ENST00000424519 ADGRB2O60241 1585 aa21.89■■□□□ 1.09
MTM1-204ENST00000424519 SLIT2O94813 1529 aa21.88■■□□□ 1.09
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MTM1-204ENST00000424519 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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MTM1-204ENST00000424519 GLI3P10071 1580 aa21.83■■□□□ 1.09
MTM1-204ENST00000424519 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.83■■□□□ 1.09
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MTM1-204ENST00000424519 ABCA3Q99758 1704 aa21.82■■□□□ 1.08
MTM1-204ENST00000424519 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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MTM1-204ENST00000424519 ALS2Q96Q42 1657 aa21.79■■□□□ 1.08
MTM1-204ENST00000424519 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
MTM1-204ENST00000424519 VPS72Q15906 364 aa21.79■■□□□ 1.08
MTM1-204ENST00000424519 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.79■■□□□ 1.08
MTM1-204ENST00000424519 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.77■■□□□ 1.08
MTM1-204ENST00000424519 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.77■■□□□ 1.08
MTM1-204ENST00000424519 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.77■■□□□ 1.08
MTM1-204ENST00000424519 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.77■■□□□ 1.08
MTM1-204ENST00000424519 BTG4Q9NY30 223 aa21.76■■□□□ 1.07
MTM1-204ENST00000424519 ATP7BP35670 1465 aa21.76■■□□□ 1.07
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