RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 GLI2P10070 1586 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 WWC1Q8IX03 1113 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 MTHFSP49914 203 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 MS4A1P11836 297 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 SLC24A1O60721 1099 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 E9PSI1 815 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-202ENST00000420808 TNNQ9UQP3 1299 aa20.33■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 PIK3C2BO00750 1634 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 RGS3P49796 1198 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 PANK1Q8TE04 598 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 IGHDP01880 384 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 RICTORQ6R327 1708 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 EVC2Q86UK5 1308 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 COG6Q9Y2V7 657 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 NEO1Q92859 1461 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 BCL11AQ9H165 835 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-202ENST00000420808 SLC4A3P48751 1232 aa20.27■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 RUNDC1Q96C34 613 aa20.27■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 C8orf34Q49A92 452 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 A0A1W2PP64 1363 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 RLBP1P12271 317 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 PRAM1Q96QH2 718 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 USP32Q8NFA0 1604 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-202ENST00000420808 FBLN1P23142 703 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 PTPRMP28827 1452 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 FAM161AQ3B820 660 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 CFAP53Q96M91 514 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 FYB1O15117 783 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 PDE3AQ14432 1141 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 POGKQ9P215 609 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 NGEFQ8N5V2 710 aa20.14■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 ABCC11Q96J66 1382 aa20.14■□□□□ 0.82
NISCH-202ENST00000420808 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.14■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.14■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 MLECQ14165 292 aa20.13■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.12■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 WDR63Q8IWG1 891 aa20.12■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 TSPOAP1O95153 1857 aa20.12■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 ZFYVE9O95405 1425 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 CABP1Q9NZU7 370 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 SEC24BO95487 1268 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 NEFMP07197 916 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 CDK19Q9BWU1 502 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 NLRP1Q9C000 1473 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 NSD2O96028 1365 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 ALKQ9UM73 1620 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 CCDC27Q2M243 656 aa20.08■□□□□ 0.81
NISCH-202ENST00000420808 ADGRB2O60241 1585 aa20.08■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 USP19O94966 1318 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms