RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412135.6

FGFR3-204, Transcript of fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FGFR3, Length 3,951 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3-204ENST00000412135 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.38■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.38■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 DTNBO60941 627 aa20.37■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 PTPRGP23470 1445 aa20.36■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 CLCN1P35523 988 aa20.35■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 KANK1Q14678 1352 aa20.35■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 C14orf37Q86TY3 774 aa20.35■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.35■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.35■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 MLECQ14165 292 aa20.34■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 USP19O94966 1318 aa20.34■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.34■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.33■□□□□ 0.85
FGFR3-204ENST00000412135 DRC7Q8IY82 874 aa20.33■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.33■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 SYCE3A1L190 88 aa20.32■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.32■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 IQGAP2Q13576 1575 aa20.32■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.32■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 PRKAR2BP31323 418 aa20.32■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 ST18O60284 1047 aa20.31■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 FAM177BA6PVY3 158 aa20.31■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.31■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 DCTN1Q14203 1278 aa20.31■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.31■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.3■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.3■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 UQCRHP07919 91 aa20.3■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 NEK4P51957 841 aa20.29■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.29■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.29■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.29■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.29■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 CCDC27Q2M243 656 aa20.28■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 KCNJ4P48050 445 aa20.27■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
FGFR3-204ENST00000412135 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.26■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.26■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 CUL7Q14999 1698 aa20.26■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.26■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.25■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 CDC45O75419 566 aa20.25■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 WDR63Q8IWG1 891 aa20.24■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 ERBB4Q15303 1308 aa20.24■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.24■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.23■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.22■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 SPC24Q8NBT2 197 aa20.22■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 TSC1Q92574 1164 aa20.22■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 KIF16BQ96L93 1317 aa20.22■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 EVC2Q86UK5 1308 aa20.21■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.21■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.21■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 TPM2P07951 284 aa20.21■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
FGFR3-204ENST00000412135 IGSF3O75054 1194 aa20.2■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.2■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 ZNF592Q92610 1267 aa20.19■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.19■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 FBXW7Q969H0 707 aa20.19■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 PTMSP20962 102 aa20.19■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 MCCP23508 829 aa20.19■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 NUCB2P80303 420 aa20.19■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.19■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 PKP1Q13835 747 aa20.19■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 KDM5CP41229 1560 aa20.18■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 FAM83GA6ND36 823 aa20.17■□□□□ 0.82
FGFR3-204ENST00000412135 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms