RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRR20BP86481 221 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRR20AP86496 221 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-55P-201ENST00000411092 Q3C1V9 767 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-55P-201ENST00000411092 POTECB2RU33 542 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-55P-201ENST00000411092 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-55P-201ENST00000411092 MSS51Q4VC12 460 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-55P-201ENST00000411092 PKDCCQ504Y2 493 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM187AA6NFU0 413 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 GUCA2AQ02747 115 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 AMHR2Q16671 573 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 ST8SIA5O15466 376 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 DGAT1O75907 488 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPIAP49247 311 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 MMP16P51512 607 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 FOXC1Q12948 553 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIM66O15016 1216 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 FDX1P10109 184 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 AK7Q96M32 723 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-55P-201ENST00000411092 NDUFV2P19404 249 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 AAASQ9NRG9 546 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 C6orf229H3BNL8 230 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 RETREG3Q86VR2 466 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 DACH1Q9UI36 760 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 JUNDP17535 347 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIM32Q13049 653 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 MS4A1P11836 297 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDE4DQ08499 809 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYP4X1Q8N118 509 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 WNT7AO00755 349 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 MTMR2Q13614 643 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 AVPP01185 164 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 SKOR1P84550 965 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRR7Q8TB68 274 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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RNU6-55P-201ENST00000411092 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 GJA5P36382 358 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTPRNQ16849 979 aa6.49□□□□□ -1.37
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RNU6-55P-201ENST00000411092 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC24A1O60721 1099 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 HRCP23327 699 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 WNT7BP56706 349 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 BCANQ96GW7 911 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 J3QL48 77 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 AXIN1O15169 862 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 SMPD1P17405 629 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 DESI1Q6ICB0 168 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.47□□□□□ -1.37
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RNU6-55P-201ENST00000411092 TREML4Q6UXN2 200 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 SH3BP2P78314 561 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 CTHP32929 405 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 LINC01559Q495D7 138 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 LYPD8Q6UX82 237 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 BAP1Q92560 729 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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