RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC125Q86Z20 511 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 HFM1A2PYH4 1435 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 PXDNQ92626 1479 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 FOXO3O43524 673 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.37■■■□□ 2.29
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HOXD12-201ENST00000404162 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.35■■■□□ 2.29
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HOXD12-201ENST00000404162 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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HOXD12-201ENST00000404162 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 PPLO60437 1756 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 SLIT2O94813 1529 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 NAIPQ13075 1403 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 STK26Q9P289 416 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 USP32Q8NFA0 1604 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 TECPR2O15040 1411 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 VPS72Q15906 364 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 LRP5O75197 1615 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 KIF1AQ12756 1690 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHG5O94827 1062 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC11Q96J66 1382 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.12■■■□□ 2.25
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HOXD12-201ENST00000404162 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 RGL3Q3MIN7 710 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.09■■■□□ 2.25
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HOXD12-201ENST00000404162 IFT172Q9UG01 1749 aa29.06■■■□□ 2.24
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HOXD12-201ENST00000404162 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
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HOXD12-201ENST00000404162 BAG6P46379 1132 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.03■■■□□ 2.24
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HOXD12-201ENST00000404162 MYT1Q01538 1121 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3C2GO75747 1445 aa29.01■■■□□ 2.23
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HOXD12-201ENST00000404162 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.99■■■□□ 2.23
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HOXD12-201ENST00000404162 FAM182BQ5T319 152 aa28.95■■■□□ 2.22
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HOXD12-201ENST00000404162 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
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HOXD12-201ENST00000404162 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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HOXD12-201ENST00000404162 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.89■■■□□ 2.22
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HOXD12-201ENST00000404162 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
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HOXD12-201ENST00000404162 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 ALS2Q96Q42 1657 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXD12-201ENST00000404162 DISP2A7MBM2 1401 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXD12-201ENST00000404162 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.8■■■□□ 2.2
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