RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC125Q86Z20 511 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 HFM1A2PYH4 1435 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 PXDNQ92626 1479 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 FOXO3O43524 673 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD12-201ENST00000404162 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 GLI3P10071 1580 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2FA1L443 756 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD12-201ENST00000404162 PPLO60437 1756 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 SLIT2O94813 1529 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 NAIPQ13075 1403 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 STK26Q9P289 416 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 USP32Q8NFA0 1604 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXD12-201ENST00000404162 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 TECPR2O15040 1411 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 VPS72Q15906 364 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 LRP5O75197 1615 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 KIF1AQ12756 1690 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHG5O94827 1062 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC11Q96J66 1382 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
HOXD12-201ENST00000404162 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 RGL3Q3MIN7 710 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD12-201ENST00000404162 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 IFT172Q9UG01 1749 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 PSME1Q06323 249 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 HRCP23327 699 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA3Q99758 1704 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 FAM83GA6ND36 823 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 BAG6P46379 1132 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0G2JS52 829 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 MYT1Q01538 1121 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3C2GO75747 1445 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD12-201ENST00000404162 SBNO1A3KN83 1393 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD12-201ENST00000404162 SIRT1Q96EB6 747 aa29■■■□□ 2.23
HOXD12-201ENST00000404162 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD12-201ENST00000404162 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
HOXD12-201ENST00000404162 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF10O15013 1369 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD12-201ENST00000404162 NRAPQ86VF7 1730 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD12-201ENST00000404162 FAM182BQ5T319 152 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD12-201ENST00000404162 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD12-201ENST00000404162 BTG4Q9NY30 223 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD12-201ENST00000404162 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
HOXD12-201ENST00000404162 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
HOXD12-201ENST00000404162 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
HOXD12-201ENST00000404162 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXD12-201ENST00000404162 PRAM1Q96QH2 718 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXD12-201ENST00000404162 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXD12-201ENST00000404162 ALS2Q96Q42 1657 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXD12-201ENST00000404162 DISP2A7MBM2 1401 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXD12-201ENST00000404162 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms