RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 DEF6Q9H4E7 631 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 CCDC192P0DO97 292 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 CHMP4CQ96CF2 233 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CEP89Q96ST8 783 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 GGT6Q6P531 493 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 PANK2Q9BZ23 570 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 RNF20Q5VTR2 975 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 WDR97A6NE52 1622 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 MCM2P49736 904 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CPLX1O14810 134 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 DYNC1I1O14576 645 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CAGE1Q8TC20 777 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 ROCK1Q13464 1354 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CCP110O43303 1012 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CDR1P51861 262 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 KINO60870 393 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 C20orf194Q5TEA3 1177 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 TRIM29Q14134 588 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 OLFM4Q6UX06 510 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 TNMDQ9H2S6 317 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 WIZO95785 1651 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 PPP2R1AP30153 589 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 NECTIN2Q92692 538 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 KIAA0754O94854 1291 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 SSFA2P28290 1259 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 USP8P40818 1118 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HERC3-202ENST00000402738 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 DCTN1Q14203 1278 aa11.71□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 UBXN4Q92575 508 aa11.71□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 GCC1Q96CN9 775 aa11.71□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 KIF21BO75037 1637 aa11.71□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 GPATCH11Q8N954 259 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 ERLIN1O75477 346 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 USP25Q9UHP3 1055 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 PDCP20941 246 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 CCDC102AQ96A19 550 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 KIF3BO15066 747 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 GNAI1P63096 354 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 MVPQ14764 893 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 ERC2O15083 957 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
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HERC3-202ENST00000402738 SMARCA2P51531 1590 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 MCM5P33992 734 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 TIGD1Q96MW7 591 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 MARCH6O60337 910 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 PTPN14Q15678 1187 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 MIA2Q96PC5 1412 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 SERPINC1P01008 464 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 AMPHP49418 695 aa11.67□□□□□ -0.54
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