RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.08■■□□□ 1.61
SEH1L-202ENST00000399892 ATF3P18847 181 aa25.08■■□□□ 1.61
SEH1L-202ENST00000399892 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SEH1L-202ENST00000399892 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.07■■□□□ 1.6
SEH1L-202ENST00000399892 TOM1O60784 492 aa25.07■■□□□ 1.6
SEH1L-202ENST00000399892 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.05■■□□□ 1.6
SEH1L-202ENST00000399892 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SEH1L-202ENST00000399892 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SEH1L-202ENST00000399892 DCCP43146 1447 aa25.02■■□□□ 1.6
SEH1L-202ENST00000399892 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SEH1L-202ENST00000399892 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.01■■□□□ 1.59
SEH1L-202ENST00000399892 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SEH1L-202ENST00000399892 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.99■■□□□ 1.59
SEH1L-202ENST00000399892 PIP4K2BP78356 416 aa24.98■■□□□ 1.59
SEH1L-202ENST00000399892 USP47Q96K76 1375 aa24.97■■□□□ 1.59
SEH1L-202ENST00000399892 SLAIN2Q9P270 581 aa24.96■■□□□ 1.59
SEH1L-202ENST00000399892 ADGRB2O60241 1585 aa24.95■■□□□ 1.58
SEH1L-202ENST00000399892 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SEH1L-202ENST00000399892 NUTM2FA1L443 756 aa24.93■■□□□ 1.58
SEH1L-202ENST00000399892 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.93■■□□□ 1.58
SEH1L-202ENST00000399892 FBXO41Q8TF61 875 aa24.92■■□□□ 1.58
SEH1L-202ENST00000399892 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.92■■□□□ 1.58
SEH1L-202ENST00000399892 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SEH1L-202ENST00000399892 MST1RQ04912 1400 aa24.91■■□□□ 1.58
SEH1L-202ENST00000399892 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
SEH1L-202ENST00000399892 EVC2Q86UK5 1308 aa24.89■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 CDK19Q9BWU1 502 aa24.88■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.87■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.87■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 SLC24A1O60721 1099 aa24.86■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.86■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.86■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.84■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.83■■□□□ 1.57
SEH1L-202ENST00000399892 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 BRINP3Q76B58 766 aa24.82■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 ORAI2Q96SN7 254 aa24.82■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 CABP2Q9NPB3 220 aa24.82■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 TESK2Q96S53 571 aa24.81■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 ITSN1Q15811 1721 aa24.8■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 TMF1P82094 1093 aa24.79■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 USP32Q8NFA0 1604 aa24.79■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.77■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.77■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 ATP7BP35670 1465 aa24.77■■□□□ 1.56
SEH1L-202ENST00000399892 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.76■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 KIF1AQ12756 1690 aa24.76■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.75■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 CDCA8Q53HL2 280 aa24.74■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.73■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 FOXO3O43524 673 aa24.72■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 PHLPP1O60346 1717 aa24.72■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.71■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.71■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.71■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.71■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
SEH1L-202ENST00000399892 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.7■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 HSPA1LP34931 641 aa24.7■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 PSME1Q06323 249 aa24.68■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 TMC1Q8TDI8 760 aa24.68■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 CABP1Q9NZU7 370 aa24.68■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.68■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.65■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 ACEP12821 1306 aa24.65■■□□□ 1.54
SEH1L-202ENST00000399892 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.63■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.6■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.6■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 PXDNQ92626 1479 aa24.59■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.58■■□□□ 1.53
SEH1L-202ENST00000399892 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.56■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 AKAP12Q02952 1782 aa24.55■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 JCADQ9P266 1359 aa24.53■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 SBNO1A3KN83 1393 aa24.53■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.52■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 MYOM1P52179 1685 aa24.52■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 USP6P35125 1406 aa24.52■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.52■■□□□ 1.52
SEH1L-202ENST00000399892 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SEH1L-202ENST00000399892 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.51■■□□□ 1.51
SEH1L-202ENST00000399892 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SEH1L-202ENST00000399892 A0A1W2PP64 1363 aa24.5■■□□□ 1.51
SEH1L-202ENST00000399892 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms