RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
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HOXD13-201ENST00000392539 DEKP35659 375 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.09
HOXD13-201ENST00000392539 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.32■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 WWC1Q8IX03 1113 aa34.31■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 BCAR3O75815 825 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 DDRGK1Q96HY6 314 aa34.3■■■■□ 3.08
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HOXD13-201ENST00000392539 RUNDC1Q96C34 613 aa34.28■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 EVC2Q86UK5 1308 aa34.28■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.26■■■■□ 3.08
HOXD13-201ENST00000392539 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.26■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.26■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 PDE3AQ14432 1141 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 NSD2O96028 1365 aa34.24■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 FAM161AQ3B820 660 aa34.23■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 CFAP53Q96M91 514 aa34.23■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 RICTORQ6R327 1708 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 RAPGEF3O95398 923 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD13-201ENST00000392539 ZFYVE9O95405 1425 aa34.19■■■■□ 3.06
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HOXD13-201ENST00000392539 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
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HOXD13-201ENST00000392539 C8orf34Q49A92 452 aa34.15■■■■□ 3.06
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HOXD13-201ENST00000392539 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.14■■■■□ 3.06
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HOXD13-201ENST00000392539 NEUROD2Q15784 382 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXD13-201ENST00000392539 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
HOXD13-201ENST00000392539 IDI1Q13907 227 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXD13-201ENST00000392539 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
HOXD13-201ENST00000392539 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
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HOXD13-201ENST00000392539 RGS3P49796 1198 aa34.09■■■■□ 3.05
HOXD13-201ENST00000392539 USP35Q9P2H5 1018 aa34.09■■■■□ 3.05
HOXD13-201ENST00000392539 CLUAP1Q96AJ1 413 aa34.08■■■■□ 3.05
HOXD13-201ENST00000392539 RARSP54136 660 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
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HOXD13-201ENST00000392539 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.07■■■■□ 3.04
HOXD13-201ENST00000392539 AAMPQ13685 434 aa34.06■■■■□ 3.04
HOXD13-201ENST00000392539 ADGRB2O60241 1585 aa34.05■■■■□ 3.04
HOXD13-201ENST00000392539 IGHDP01880 384 aa34.05■■■■□ 3.04
HOXD13-201ENST00000392539 PANK1Q8TE04 598 aa34.04■■■■□ 3.04
HOXD13-201ENST00000392539 COG6Q9Y2V7 657 aa34.04■■■■□ 3.04
HOXD13-201ENST00000392539 ABCC11Q96J66 1382 aa34.03■■■■□ 3.04
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HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PP64 1363 aa34■■■■□ 3.03
HOXD13-201ENST00000392539 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
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HOXD13-201ENST00000392539 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP33.98■■■■□ 3.03
HOXD13-201ENST00000392539 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa33.98■■■■□ 3.03
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HOXD13-201ENST00000392539 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXD13-201ENST00000392539 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
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HOXD13-201ENST00000392539 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
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HOXD13-201ENST00000392539 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
HOXD13-201ENST00000392539 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
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HOXD13-201ENST00000392539 RLBP1P12271 317 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXD13-201ENST00000392539 GGNBP2Q9H3C7 697 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXD13-201ENST00000392539 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
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HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHF1Q96S99 279 aa33.85■■■■□ 3.01
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HOXD13-201ENST00000392539 SLC4A3P48751 1232 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXD13-201ENST00000392539 NLRP1Q9C000 1473 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXD13-201ENST00000392539 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
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HOXD13-201ENST00000392539 ZMYM3Q14202 1370 aa33.82■■■■□ 3
HOXD13-201ENST00000392539 TNNQ9UQP3 1299 aa33.82■■■■□ 3
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa33.81■■■■□ 3
HOXD13-201ENST00000392539 TMPOP42166 694 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
HOXD13-201ENST00000392539 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
HOXD13-201ENST00000392539 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa33.8■■■■□ 3
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