RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390604.2

IGHV3-16-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional), humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-16, Length 425 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16-201ENST00000390604 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 NEUROD1Q13562 356 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 STAC3Q96MF2 364 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 ORAI2Q96SN7 254 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 IFT172Q9UG01 1749 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-16-201ENST00000390604 MYOM2P54296 1465 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 PIK3C2GO75747 1445 aa22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 USP21Q9UK80 565 aa22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-16-201ENST00000390604 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-16-201ENST00000390604 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-16-201ENST00000390604 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-16-201ENST00000390604 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-16-201ENST00000390604 STK26Q9P289 416 aa22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-16-201ENST00000390604 PTCH1Q13635 1447 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-16-201ENST00000390604 EP400Q96L91 3159 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-16-201ENST00000390604 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 ATRNO75882 1429 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 ABCC11Q96J66 1382 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 LAMC1P11047 1609 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 TONSLQ96HA7 1378 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-16-201ENST00000390604 FOXO3O43524 673 aa22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 SIRT1Q96EB6 747 aa22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 TECPR2O15040 1411 aa22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 NUTM2FA1L443 756 aa22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 ADGRB1O14514 1584 aa22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 CCDC125Q86Z20 511 aa22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 PRAM1Q96QH2 718 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-16-201ENST00000390604 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.08■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 PXDNQ92626 1479 aa22.08■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 POGKQ9P215 609 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 DLC1Q96QB1 1528 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-16-201ENST00000390604 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-16-201ENST00000390604 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-16-201ENST00000390604 RALGAPBQ86X10 1494 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-16-201ENST00000390604 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-16-201ENST00000390604 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-16-201ENST00000390604 SLIT2O94813 1529 aa21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-16-201ENST00000390604 PLEKHG5O94827 1062 aa21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-16-201ENST00000390604 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-16-201ENST00000390604 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-16-201ENST00000390604 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 GLI3P10071 1580 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 VPS72Q15906 364 aa21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-16-201ENST00000390604 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 PSME1Q06323 249 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 USP32Q8NFA0 1604 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 FAM83GA6ND36 823 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-16-201ENST00000390604 CDK19Q9BWU1 502 aa21.84■■□□□ 1.09
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