RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.92■■□□□ 1.74
PAN3-201ENST00000380958 GGT6Q6P531 493 aa25.92■■□□□ 1.74
PAN3-201ENST00000380958 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PAN3-201ENST00000380958 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PAN3-201ENST00000380958 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.88■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 GLI2P10070 1586 aa25.88■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.87■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.86■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 RICTORQ6R327 1708 aa25.86■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 E9PSI1 815 aa25.85■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 ZFYVE9O95405 1425 aa25.84■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.84■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PAN3-201ENST00000380958 APAF1O14727 1248 aa25.82■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 SHPRHQ149N8 1683 aa25.81■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 NSD2O96028 1365 aa25.81■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.81■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.8■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.79■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 MORC1Q86VD1 984 aa25.79■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 BCAR3O75815 825 aa25.78■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 EVC2Q86UK5 1308 aa25.78■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.78■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.77■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.77■■□□□ 1.72
PAN3-201ENST00000380958 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.76■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.76■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 RAPGEF3O95398 923 aa25.75■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 NFKBIBQ15653 356 aa25.75■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 USP35Q9P2H5 1018 aa25.74■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.74■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.73■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.73■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 C8orf34Q49A92 452 aa25.72■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.72■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 FAM161AQ3B820 660 aa25.72■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.71■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.71■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 NEUROD2Q15784 382 aa25.71■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 RUNDC1Q96C34 613 aa25.71■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 CFAP53Q96M91 514 aa25.7■■□□□ 1.71
PAN3-201ENST00000380958 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.7■■□□□ 1.7
PAN3-201ENST00000380958 WWC1Q8IX03 1113 aa25.69■■□□□ 1.7
PAN3-201ENST00000380958 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.68■■□□□ 1.7
PAN3-201ENST00000380958 PDE3AQ14432 1141 aa25.67■■□□□ 1.7
PAN3-201ENST00000380958 IDI1Q13907 227 aa25.66■■□□□ 1.7
PAN3-201ENST00000380958 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.65■■□□□ 1.7
PAN3-201ENST00000380958 CCDC27Q2M243 656 aa25.65■■□□□ 1.7
PAN3-201ENST00000380958 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PAN3-201ENST00000380958 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PAN3-201ENST00000380958 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 GSE1Q14687 1217 aa25.64■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 WDR63Q8IWG1 891 aa25.64■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 IGHDP01880 384 aa25.63■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 ABCC11Q96J66 1382 aa25.62■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 PANK1Q8TE04 598 aa25.61■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.61■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.61■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 REREQ9P2R6 1566 aa25.61■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 MTHFSP49914 203 aa25.61■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 COG6Q9Y2V7 657 aa25.61■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 AAMPQ13685 434 aa25.6■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 MED14O60244 1454 aa25.6■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 PTPRMP28827 1452 aa25.6■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 ADGRB2O60241 1585 aa25.59■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.59■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.58■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 ZMYND15Q9H091 742 aa25.58■■□□□ 1.69
PAN3-201ENST00000380958 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.56■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.55■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 A0A1W2PP64 1363 aa25.55■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 AGLP35573 1532 aa25.55■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 SEC24BO95487 1268 aa25.54■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.54■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 CABP2Q9NPB3 220 aa25.54■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.52■■□□□ 1.68
PAN3-201ENST00000380958 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.51■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 ALKQ9UM73 1620 aa25.51■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 TNNQ9UQP3 1299 aa25.5■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.49■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 DIP2BQ9P265 1576 aa25.48■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.7 ms