RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371315.3

MCTS1-201, Transcript of MCTS1, re-initiation and release factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MCTS1, Length 1,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTS1-201ENST00000371315 LAMC1P11047 1609 aa14.86□□□□□ -0.03
MCTS1-201ENST00000371315 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.85□□□□□ -0.03
MCTS1-201ENST00000371315 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MCTS1-201ENST00000371315 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.84□□□□□ -0.03
MCTS1-201ENST00000371315 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.83□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 C8orf37Q96NL8 207 aa14.82□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 PPLO60437 1756 aa14.82□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 HFM1A2PYH4 1435 aa14.81□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 RGS12O14924 1447 aa14.81□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.8□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 DSG3P32926 999 aa14.78□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 ORAI2Q96SN7 254 aa14.78□□□□□ -0.04
MCTS1-201ENST00000371315 ADAMTS2O95450 1211 aa14.77□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 NGLY1Q96IV0 654 aa14.76□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.76□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.75□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 EP400Q96L91 3159 aa14.73□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 MYOM2P54296 1465 aa14.72□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 PXDNQ92626 1479 aa14.72□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 USP21Q9UK80 565 aa14.72□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 IFT172Q9UG01 1749 aa14.72□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.71□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 TECPR2O15040 1411 aa14.71□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 ATRNO75882 1429 aa14.71□□□□□ -0.05
MCTS1-201ENST00000371315 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.69□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.68□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 ABCC11Q96J66 1382 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 FOXO3O43524 673 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 RGL3Q3MIN7 710 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 STK26Q9P289 416 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 PIK3C2GO75747 1445 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.65□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 KIF1AQ12756 1690 aa14.65□□□□□ -0.06
MCTS1-201ENST00000371315 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.64□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 NUTM2FA1L443 756 aa14.63□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.63□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.61□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 SIRT1Q96EB6 747 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 SLIT2O94813 1529 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 USP32Q8NFA0 1604 aa14.59□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 GLI3P10071 1580 aa14.59□□□□□ -0.07
MCTS1-201ENST00000371315 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.58□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.58□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 CCDC125Q86Z20 511 aa14.58□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.58□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.55□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.55□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 ABCA3Q99758 1704 aa14.55□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.55□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.55□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 PSME1Q06323 249 aa14.54□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.54□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 SBNO1A3KN83 1393 aa14.54□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.54□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 DLC1Q96QB1 1528 aa14.53□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.52□□□□□ -0.08
MCTS1-201ENST00000371315 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 PRAM1Q96QH2 718 aa14.52□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 ADGRB2O60241 1585 aa14.51□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.51□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 ARHGEF10O15013 1369 aa14.51□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 ABCB7O75027 752 aa14.51□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.51□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 VPS72Q15906 364 aa14.5□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 ADGRB1O14514 1584 aa14.49□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.49□□□□□ -0.09
MCTS1-201ENST00000371315 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms