RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370546.5

HPSE2-201, Transcript of heparanase 2 (inactive), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPSE2, Length 1,849 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSE2-201ENST00000370546 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.83■□□□□ 0.29
HPSE2-201ENST00000370546 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.83■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 PIK3C2BO00750 1634 aa16.82■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 GLI2P10070 1586 aa16.81■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.81■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 PDE3AQ14432 1141 aa16.81■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 SKAP1Q86WV1 359 aa16.81■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 NSD2O96028 1365 aa16.79■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 C8orf34Q49A92 452 aa16.79■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 MORC1Q86VD1 984 aa16.79■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 CD109Q6YHK3 1445 aa16.78■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 WWC1Q8IX03 1113 aa16.78■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 RUNDC1Q96C34 613 aa16.77■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.77■□□□□ 0.28
HPSE2-201ENST00000370546 BCAR3O75815 825 aa16.77■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 NEFMP07197 916 aa16.77■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.76■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 AAMPQ13685 434 aa16.76■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.76■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.76■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 NEO1Q92859 1461 aa16.75■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.75■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 ADGRB2O60241 1585 aa16.74■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa16.74■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 CCDC27Q2M243 656 aa16.74■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 WDR63Q8IWG1 891 aa16.74■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 CFAP53Q96M91 514 aa16.74■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.73■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.73■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.73■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.73■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.72■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 EVC2Q86UK5 1308 aa16.72■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 ZFYVE9O95405 1425 aa16.71■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 ZMYM3Q14202 1370 aa16.71■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HPSE2-201ENST00000370546 RGS3P49796 1198 aa16.7■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 GGT6Q6P531 493 aa16.7■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.7■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.69■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.68■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 IGHDP01880 384 aa16.68■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 MTHFSP49914 203 aa16.68■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.67■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 RICTORQ6R327 1708 aa16.66■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 ABCC11Q96J66 1382 aa16.66■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 PANK1Q8TE04 598 aa16.66■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.66■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 COG6Q9Y2V7 657 aa16.66■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HPSE2-201ENST00000370546 MED14O60244 1454 aa16.64■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.63■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 NFKBIBQ15653 356 aa16.63■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 NEUROD2Q15784 382 aa16.62■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.62■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.61■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.61■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.61■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 PTPRMP28827 1452 aa16.61■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 A0A1W2PP64 1363 aa16.6■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 NLRP1Q9C000 1473 aa16.6■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 SLC4A3P48751 1232 aa16.59■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 USP19O94966 1318 aa16.59■□□□□ 0.25
HPSE2-201ENST00000370546 CABP2Q9NPB3 220 aa16.58■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 RLBP1P12271 317 aa16.57■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.57■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 IL16Q14005 1332 aa16.56■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.56■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 IDI1Q13907 227 aa16.56■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 GSE1Q14687 1217 aa16.56■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.56■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 RAPGEF3O95398 923 aa16.55■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 BECN1Q14457 450 aa16.55■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.55■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.55■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.55■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.54■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms