RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370495.5

SLC25A28-201, Transcript of solute carrier family 25 member 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A28, Length 1,451 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A28-201ENST00000370495 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa43.69■■■■■ 4.58
SLC25A28-201ENST00000370495 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP43.69■■■■■ 4.58
SLC25A28-201ENST00000370495 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
SLC25A28-201ENST00000370495 QRICH2Q9H0J4 1663 aa43.67■■■■■ 4.58
SLC25A28-201ENST00000370495 NALCNQ8IZF0 1738 aa43.67■■■■■ 4.58
SLC25A28-201ENST00000370495 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
SLC25A28-201ENST00000370495 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
SLC25A28-201ENST00000370495 MSH6P52701 1360 aa43.64■■■■■ 4.58
SLC25A28-201ENST00000370495 CERKQ8TCT0 537 aa43.63■■■■■ 4.57
SLC25A28-201ENST00000370495 C19orf44Q9H6X5 657 aa43.62■■■■■ 4.57
SLC25A28-201ENST00000370495 ADGRB2O60241 1585 aa43.57■■■■■ 4.56
SLC25A28-201ENST00000370495 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa43.56■■■■■ 4.56
SLC25A28-201ENST00000370495 TESK2Q96S53 571 aa43.55■■■■■ 4.56
SLC25A28-201ENST00000370495 IQSEC2Q5JU85 1478 aa43.55■■■■■ 4.56
SLC25A28-201ENST00000370495 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa43.55■■■■■ 4.56
SLC25A28-201ENST00000370495 DCCP43146 1447 aa43.53■■■■■ 4.56
SLC25A28-201ENST00000370495 ATF3P18847 181 aa43.51■■■■■ 4.56
SLC25A28-201ENST00000370495 WASLO00401 505 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
SLC25A28-201ENST00000370495 CADPS2Q86UW7 1296 aa43.48■■■■■ 4.55
SLC25A28-201ENST00000370495 TULP4Q9NRJ4 1543 aa43.48■■■■■ 4.55
SLC25A28-201ENST00000370495 EVC2Q86UK5 1308 aa43.45■■■■■ 4.55
SLC25A28-201ENST00000370495 CDK19Q9BWU1 502 aa43.44■■■■■ 4.54
SLC25A28-201ENST00000370495 NUTM2FA1L443 756 aa43.41■■■■■ 4.54
SLC25A28-201ENST00000370495 SLC24A1O60721 1099 aa43.4■■■■■ 4.54
SLC25A28-201ENST00000370495 FMN2Q9NZ56 1722 aa43.4■■■■■ 4.54
SLC25A28-201ENST00000370495 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
SLC25A28-201ENST00000370495 TMF1P82094 1093 aa43.38■■■■■ 4.54
SLC25A28-201ENST00000370495 DISP3Q9P2K9 1392 aa43.38■■■■■ 4.53
SLC25A28-201ENST00000370495 MST1RQ04912 1400 aa43.37■■■■■ 4.53
SLC25A28-201ENST00000370495 CABP2Q9NPB3 220 aa43.37■■■■■ 4.53
SLC25A28-201ENST00000370495 UBAP1LF5GYI3 381 aa43.34■■■■■ 4.53
SLC25A28-201ENST00000370495 TOM1O60784 492 aa43.32■■■■■ 4.53
SLC25A28-201ENST00000370495 SLAIN2Q9P270 581 aa43.32■■■■■ 4.53
SLC25A28-201ENST00000370495 C1orf167Q5SNV9 1468 aa43.32■■■■■ 4.52
SLC25A28-201ENST00000370495 ANKARQ7Z5J8 1434 aa43.31■■■■■ 4.52
SLC25A28-201ENST00000370495 PRR36Q9H6K5 1346 aa43.3■■■■■ 4.52
SLC25A28-201ENST00000370495 ATP7BP35670 1465 aa43.29■■■■■ 4.52
SLC25A28-201ENST00000370495 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
SLC25A28-201ENST00000370495 USP32Q8NFA0 1604 aa43.28■■■■■ 4.52
SLC25A28-201ENST00000370495 CDCA8Q53HL2 280 aa43.24■■■■■ 4.51
SLC25A28-201ENST00000370495 ATAD2Q6PL18 1390 aa43.22■■■■■ 4.51
SLC25A28-201ENST00000370495 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
SLC25A28-201ENST00000370495 ESCO1Q5FWF5 840 aa43.2■■■■■ 4.51
SLC25A28-201ENST00000370495 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
SLC25A28-201ENST00000370495 ORAI2Q96SN7 254 aa43.2■■■■■ 4.51
SLC25A28-201ENST00000370495 PIP4K2BP78356 416 aa43.19■■■■■ 4.51
SLC25A28-201ENST00000370495 CCDC61Q9Y6R9 512 aa43.19■■■■■ 4.5
SLC25A28-201ENST00000370495 POLR3GLQ9BT43 218 aa43.18■■■■■ 4.5
SLC25A28-201ENST00000370495 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
SLC25A28-201ENST00000370495 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
SLC25A28-201ENST00000370495 BRINP3Q76B58 766 aa43.15■■■■■ 4.5
SLC25A28-201ENST00000370495 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa43.15■■■■■ 4.5
SLC25A28-201ENST00000370495 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa43.14■■■■■ 4.5
SLC25A28-201ENST00000370495 ITSN1Q15811 1721 aa43.13■■■■■ 4.49
SLC25A28-201ENST00000370495 PHF8Q9UPP1 1060 aa43.13■■■■■ 4.49
SLC25A28-201ENST00000370495 KIF7Q2M1P5 1343 aa43.12■■■■■ 4.49
SLC25A28-201ENST00000370495 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa43.11■■■■■ 4.49
SLC25A28-201ENST00000370495 TMC1Q8TDI8 760 aa43.1■■■■■ 4.49
SLC25A28-201ENST00000370495 CABP1Q9NZU7 370 aa43.1■■■■■ 4.49
SLC25A28-201ENST00000370495 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa43.1■■■■■ 4.49
SLC25A28-201ENST00000370495 CCDC7Q96M83 1385 aa43.06■■■■■ 4.48
SLC25A28-201ENST00000370495 WASHC2AQ641Q2 1341 aa43.05■■■■■ 4.48
SLC25A28-201ENST00000370495 KIF1AQ12756 1690 aa43.05■■■■■ 4.48
SLC25A28-201ENST00000370495 PLEKHG3A1L390 1219 aa43.05■■■■■ 4.48
SLC25A28-201ENST00000370495 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa43.03■■■■■ 4.48
SLC25A28-201ENST00000370495 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
SLC25A28-201ENST00000370495 NINLQ9Y2I6 1382 aa43.01■■■■■ 4.48
SLC25A28-201ENST00000370495 FOXO3O43524 673 aa43■■■■■ 4.47
SLC25A28-201ENST00000370495 ACEP12821 1306 aa43■■■■■ 4.47
SLC25A28-201ENST00000370495 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
SLC25A28-201ENST00000370495 MYOM1P52179 1685 aa42.97■■■■■ 4.47
SLC25A28-201ENST00000370495 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
SLC25A28-201ENST00000370495 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.95■■■■■ 4.47
SLC25A28-201ENST00000370495 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 CD163L1Q9NR16 1453 aa42.91■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 NHSL1Q5SYE7 1610 aa42.9■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 PSME1Q06323 249 aa42.9■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 FBXO41Q8TF61 875 aa42.9■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 TERF2IPQ9NYB0 399 aa42.9■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
SLC25A28-201ENST00000370495 A0A1W2PP64 1363 aa42.87■■■■■ 4.45
SLC25A28-201ENST00000370495 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa42.87■■■■■ 4.45
SLC25A28-201ENST00000370495 KRT28Q7Z3Y7 464 aa42.86■■■■■ 4.45
SLC25A28-201ENST00000370495 PXDNQ92626 1479 aa42.84■■■■■ 4.45
SLC25A28-201ENST00000370495 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
SLC25A28-201ENST00000370495 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
SLC25A28-201ENST00000370495 USP6P35125 1406 aa42.82■■■■■ 4.45
SLC25A28-201ENST00000370495 AKAP12Q02952 1782 aa42.82■■■■■ 4.45
SLC25A28-201ENST00000370495 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
SLC25A28-201ENST00000370495 PHLPP1O60346 1717 aa42.8■■■■■ 4.44
SLC25A28-201ENST00000370495 PANK3Q9H999 370 aa42.78■■■■■ 4.44
SLC25A28-201ENST00000370495 MON2Q7Z3U7 1717 aa42.76■■■■■ 4.44
SLC25A28-201ENST00000370495 HSPA1LP34931 641 aa42.74■■■■■ 4.43
SLC25A28-201ENST00000370495 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
SLC25A28-201ENST00000370495 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
SLC25A28-201ENST00000370495 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
SLC25A28-201ENST00000370495 SBNO1A3KN83 1393 aa42.72■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms